瑞贝卡面容恬淡的看着虚拟屏幕，从容不迫的下达着一条条命令。在她眼里整个银河系的星图都早已映入她脑海中，她正在挥洒自如的指挥着联邦军奔向银河系中一个个战略要地。
这时在学校中央信息演示大厅内的军校老师和联盟代表们，惊奇地发现，前面还百战百胜的两大联盟的盟军，居然出现了长时间停滞不前的现象。
迈克尔。巴乔此刻也是焦头烂额，毫无办法。他知道只有继续进攻，才能获得胜利。但是如果想继需发动进攻，自由女神联盟的军队显然毫无问题，可是工业联盟的军队却因第二阶段进攻中损失太大，而获得的利益太少，而拒绝进攻。
表面上看两大联盟的盟军已经夺得了联邦的数百个星球，但实际上由于这些刚夺下的星球都还不能算真正落入两大联盟的完全掌控中。所以两大联盟军还要派出大量的部队驻守这些星球，而且瑞贝卡事先在这些星球上安排的大量敌后游击队，发挥了作用。虽然不能给两大联盟军队带来决定性的打击，但各个星球的盟军部队四处遭受攻击，还是给两大联盟军队造成不小的麻烦。
最糟糕的是，迈克尔。巴乔发现最初自己认为，其它联盟会害怕于两大联盟的强势军队，不敢介入战争。的确其它联盟的部队正如他所想那样，没有参与战争。但是背地里支持联邦可就是显而意见，因为有很多发动偷袭的联邦精英部队，分明都是借用了各联盟的星际航道过来的。当两大联盟军队准备追击这些偷袭部队时，联邦军队却从各大联盟的星际航道逃之夭夭。
如果在战争初期，两大联盟显然有足够的军队来威慑其它联盟，可是现在迈克尔。巴乔已经不敢分兵去进攻其它联盟，因为现在即使对付联邦军队也是捉襟见肘了。
迈克尔。巴乔知道现在必须速战速决，如果不能尽快发起第三阶段的进攻，那么自由联盟军队面对的困难会越来越大，直到最后崩溃。
他知道，只有完全打败联邦军队，攻入中央星域，一切难题都可以迎刃而解。
于是迈克尔。巴乔开始发出一条条命令，开始积极调动军队，准备第三阶段的进攻。为了换得工业联盟军队的支持。迈克尔。巴乔又只好让自由女神联盟的军队让出十几个占领的星球。当然迈克尔。巴乔又遭到了‘天网’系统模拟出的自由女神联盟执政政府的指责。
不过迈克尔。巴乔认为这些已经不再重要，只要把联邦军完全打败了，一切都是可以解决。
第三阶段的进攻迈克尔。巴乔在费了好大一番力气后，终于发动了。由于现在两大联盟的盟军兵力已经不如当初那样雄厚，而且得兼顾后防线上的防守。因此就不能再发动前两个阶段那样横跨好几个星域的全面进攻，而且工业联盟军队由于在第二阶段进攻中遭受巨大损失，因此不愿意承担重点进攻的人任务。
无奈的迈克尔。巴乔只好把进攻重点放在离太阳系最近的牛顿星域和麦哲伦星域。当开始进攻时，初期攻占了这两个星域的几个小星球，两大联盟的盟军还感到非常轻松。不过渐渐的迈克尔。巴乔就感到吃力起来，联邦军队的反击是越来越强。迫使他不断的向这两个星域增兵，可是情况依然没有好转。
此刻迈克尔。巴乔并不知道在银河军校的中央信息大厅里的人们，好多人都激动地站了起来。他们站起来的原因却是因为瑞贝卡指挥的联邦军队。
因为在虚拟屏幕的全息星图中，联邦军无数的精英部队开始向牛顿星域和麦哲伦星域汇集，而且联邦中央星域作为整个银河联邦的政治中心，几百年来积累下的雄厚财力和经济基础，完全展现了出来。
中央星域的数千个兵工厂早已建造出了无数的战舰，无数的士兵开始运往前线。其是人们知道联邦军队早已有反击的能力，在第二阶段防御的时候，让许多观战的军校老师和各联盟代表不明白的是瑞贝卡为什么迟迟不动用这些军队，虽然这些军队的加入不能说就此完全打败两大联盟的盟军，可是都过旗鼓相当也是没问题了。
维多夫莫列奇若有所思道：“原来那个瑞贝卡留了这么一手，看来迈克尔。巴乔要吃亏了。联邦的强大经济实力真不可小视啊！”
“没那么简单，我认为那个瑞贝卡真正的战术意图不可能就是利用这后备的优势兵力和迈克尔。巴乔拼个旗鼓相当，她的目的到底是什么呢？”竹内倩美看着虚拟屏幕苦苦思索起来。
迈克尔。巴乔在自己所在的战术模拟指挥室里，是看不到瑞贝卡组织起来的那庞大联邦军的。不过他也嗅出了危险的味道。但是他此刻没办法，自由女神联盟的精英部队已经深陷其中，要想抽身而退恐怕会付出巨大的损失。更让他抓狂的是那个由‘天网’系统所模拟的工业联盟军最高指挥官，却在此刻不愿意派工业联盟的军队上来，只愿从旁牵制联邦军队。
迈克尔。巴乔只有寄希望于不断添加上去的自由女神联盟军队，希望再一次的增兵就是压倒骆驼的最后一根稻草。不过自由女神联盟的军队不断增加，并没有打破僵局，而是每一次自由女神联盟军队的增兵，只会换来联邦军队相同兵力的增加。
当迈克尔。巴乔已经意识到这时添油战术时已经迟了。他已经把整个自由女神联盟百分之六十的部队投入这场战役中，而自由女神的精英部队也投入到了占总量的百分之八十。就是现在他想脱身也欲罢不能。
很快迈克尔。巴乔终于发现了埋伏在牛顿和麦哲伦星域外围航道上那数量惊人的联邦庞大舰队。在战场后方的工业联盟军队一件势头不妙，立刻就抢先撤了出去。而联邦军队并没有阻止撤退的工业联盟军队，只是把与联邦军绞杀在一起的自由女神联盟军队团团围住。
虽然迈克尔。巴乔后面果断下达了全线撤退的命令，但是溃局已成，不管他使劲浑身解数，最终自由女神联盟军队能逃出去的士兵数量却不足百分之十。
一向温文尔雅的迈克尔。巴乔此时已是两眼通红，死死盯着虚拟屏幕上，到现在他都还不明白自己为什么会输？联邦军那么多优势兵力是从哪里来的？工业联盟的军队要是受自己指挥，也许即使会输，以两大联盟军队的强大兵力，自由女神联盟军队的损失绝不会这么大。
铁格尔将军满脸笑意的看着虚拟屏幕，道：“瑞贝卡这个小丫头，指挥的还真是不错。反击的时候该来了，就不知道这小丫头会以怎样的方式获胜？卡斯特你以为呢？”
“我看瑞贝卡会继续利用联邦的强大经济实力，慢慢的反攻，直到把两大联盟的军队赶出联邦中央星域。”卡斯特说出了自己心理对战局的看法，不过他还是看向老师，希望能得到别的答案。
铁格尔将军却奇怪地道：“瑞贝卡如果只是这样获胜，那我可就真有点失望了。”