离开史顿镇后三人继续踏上旅程，又旅行了很久，期间小飞看了皮卡丘的技能，除了瞬间移动外皮卡丘还学会了瓦割，甚至还学会了冲浪，小飞心想应该是向美娜斯和穿山王学的吧！霸王花的实力也在路边的战斗中实力提升了不少，不过比起皮卡丘来说还是略逊一筹，迷你龙已经到了快进化的等级了，接下来只要在经历一场战斗就应该可以进化了，不过那些路边的训练家实力实在是太差，根本不足以让迷你龙进化，小飞心想黑暗市的那只电击兽和飞天螳螂应该可以让迷你龙进化。
又走了几天，小飞一直着重于提升哥达鸭的水系技能威力，虽然威力是提升了许多，但在与实力差不多的对手的对决中哥达鸭的水系技能还是不够看的。现在三人来到了有着黑暗道馆的黑暗市，看着周围的房屋正在慢慢修复中，小飞心想看来又慢小智一步了。在神奇宝贝中心恢复了神奇宝贝后，三人便来到了黑暗道馆。“现在由道馆馆主亚斯和卡兹与挑战者来自真新镇的小飞的战斗，限定神奇宝贝为两只，现在比赛开始。”裁判宣布道。（忘了黑暗市道馆关注的名字了，所以就用两个道馆的前面二字作为道馆馆主的名字，请大家见谅）“电击兽，交给你了。”“飞天螳螂，上吧。”亚斯和卡兹派出了自己的神奇宝贝。“迷你龙，哥达鸭，交给你们了。”小飞说着也派出了二宠。“上吧，电击兽，对哥达鸭使出十万伏特。”“飞天螳螂，对迷你龙使用一字斩。”亚斯和卡兹命令道。“哥达鸭，急冻光线。”“迷你龙，喷射火焰。”小飞下令道。收到命令的哥达鸭立即使出了急冻光线，巨大的威力直接将十万伏特击破，电击兽见此连忙做出闪躲避开了急冻光线，只是电击兽原来的位置上被急冻光线冻结了很大的一块冰，而迷你龙这边喷射火焰呼啸而来，飞天螳螂使出了一字斩虽然劈开了喷射火焰，但是右镰已是漆黑一片，估计暂时是无法做出攻击了。
“这威力太恐怖了吧！电击兽，千万不能让那只哥达鸭击中啊！”亚斯惊讶道。“哥达鸭，幻象术控制住电击兽，迷你龙，对电击兽使出水炮。”迷你龙对着电击兽喷出了水炮，虽然迷你龙对水炮的后座力减轻了很多，但还是被反冲力冲后了几步，“电击兽，快避开。”电击兽想要避开，但哥达鸭的幻象术已经锁定了电击兽，电击兽拼命挣扎却毫无效果，只能眼睁睁的让水炮将自己击飞了出去，电击兽收到了很大的伤害，但还未失去战斗能力，“卡兹，快帮忙啊！”亚斯喊道。“知道了，飞天螳螂，对迷你龙使用十字切。”卡兹下令道。“先不要管电击兽，哥达鸭迷你龙，暴风雪喷射火焰攻击飞天螳螂。”小飞下令道。接到命令的两只神奇宝贝立刻无视掉了电击兽，各自积蓄好了急冻光线和水炮向着飞天螳螂击去，“不好，飞天螳螂快避开。”两边的攻击突然转向了自己这边，卡兹不由大喊道。飞天螳螂听令立即开启电光一闪躲避，虽然躲开了喷射火焰，但却被紧随而来的暴风雪命中，巨大的力量加上效果拔群的攻击直接让飞天螳螂失去了战斗能力。
“这下只剩一个了，那么就结束战斗吧，哥达鸭迷你龙，双重水枪。”小飞下令道。两发一大一小的水枪直击电击兽，“电击兽，快避开。”亚斯大喊。但电击兽那重伤的身体根本无法避开水枪攻击，只得让两发水枪命中自己，接着电击兽失去了战斗能力。“飞天螳螂，电击兽失去战斗能力，这场战斗由挑战者来自真新镇的小飞获胜。”裁判宣布道。“太好了，迷你龙，哥达鸭，我们赢了。”小飞高兴的说道。迷你龙和哥达鸭也小和应了一声。突然，迷你龙全身发出了耀眼的白光，“终于进化了吗，哈克龙。”小飞喃喃道。白光消散，哈克龙出现在了场地上，“太好了小飞，迷你龙终于进化了。”小雨和蜜柑为小飞高兴道。”嗯。“小飞应了一声。接着小飞就将哈克龙和哥达鸭收了回去“你真的很强，来这是黑暗徽章，请收下。”卡兹拿出了一枚黑漆漆的徽章递给小飞道。“谢谢。”小飞接过了徽章。接着三人便离开了黑暗道馆，在神奇宝贝中心恢复完神奇宝贝的体力后，三人便再次踏上了旅程。
又走了一段路，三人来到了一个城镇，正巧这里正在举办嘉年华，三人便决定呆在这里玩一玩。只不过玩的内容对小飞有点残忍，那就是陪着两个女生逛街提东西。好不容易摆脱二女的小飞本来想在森林中休息一下，顺便训练一下月精灵它们。但是命运弄人，地面突然开始震动了起来，上百只椰蛋树向着小飞冲来，并且各各眼神都不对，好像是发狂了“又有的忙了不过正好训练一下大家，出来吧各位，陪练的来了，大家自由战斗。”小飞抛出了除裂空座外所有的神奇宝贝。（小飞现在的神奇宝贝：月精灵，百变怪，皮卡丘，哥达鸭，霸王花，裂空座，哈克龙，鬼斯通。在黑暗市小飞将鬼斯通传过来的。）虽然众神奇宝贝对突如的这么多椰蛋树吓了一跳，但仅仅是迟疑了一会便开始了攻击。
首先是月精灵的三发恶之波动，直接打倒了三只椰蛋树，皮卡丘也不甘示弱，虽然椰蛋树对电系技能有抗性，但皮卡丘的等级很好的填补了这一点，十万伏特和电球连连使出，还有霸王花的溶解液，哥达鸭的急冻光线，哈克龙的喷射火焰及龙卷风，鬼斯通的影子球以及催眠术加噩梦和食梦恢复体力，百变怪则变身成大嘴雀飞进椰蛋树群中不停地使用燕返和翅膀攻击。不一会就有一片椰蛋树倒下。小飞也不闲着，神奇宝贝球接连丢出并成功收服那些失去战斗能力的椰蛋树。渐渐地小飞的神奇宝贝们都开始喘起了气，而椰蛋树群被击倒了两三百，但放眼望去至少还有一百多只。
“这样下去不行，大家合力攻击，哥达鸭，大范围的暴风雪全力攻击。哈克龙，水炮。皮卡丘，打雷。月精灵，连发恶之波动。鬼斯通，影子球。百变怪，破坏死光。霸王花，飞叶风暴。”小飞下令道。最后又来了一只比一般椰蛋树要大一点的椰蛋树，正要攻击小飞和中神奇宝贝时，被月精灵的恶之波动，皮卡丘的打雷以及哥达鸭的急冻光线直接打飞了出去，小飞也顺势抛出了神奇宝贝球将其收服。这时听到动静的小雨和蜜柑也赶了过来，见此情景立刻从背包中拿出树果和伤药为小飞的神奇宝贝恢复体力。接着又走出了一个神情紧张的人，向三人说明了原委。原来这人是个魔术师，本想着要收服椰蛋树后能够让椰蛋树催眠城镇的人来看他表演魔术，但是一不小心让椰蛋树群暴走了，这才引起了刚刚的那一幕。
而小飞不知道的是，他跟椰蛋树群战斗的时候，有一个人正站在他背后注视着他。“小飞，你果然成长了啊！你等着，很快我就会给你个surprise的。胡地，瞬间移动。”神秘人说完便瞬间消失在了原地。