“啊~~”一声凄厉的喊声让凌云天留意。转而向那个方向赶去，空中的雨越来越大，当凌云天赶到的时候，看到的只是一个疲惫的小家伙跟奄奄一息的狮子兽。
一个龙型，背上是一对小翅膀样子的家伙转身离开了。凌云天看着耷拉个脑袋，低着头走路的家伙，怎么也想不通，这样的家伙怎么可能是虚空王座呢。那位可是队长级的人物啊，要不是凌云飞记得这是他未进化的时候的大概样子，恐怕他也不会对这个小家伙多加关注。
小家伙消沉的走到西边喝水，却遇到了蘑菇兽三兄弟。
“快滚吧，你并没有被选上哦”一个这样说。啊对了，凌云天在中途发现了一个新的能力就是将进化之力跟退化之力融合后的力量覆盖在身体上，会达到隐形的效果。
“你这个家伙跑到这里干什么，这个世界的每个地方都已经不安定了，这是安杜路兽说的哦”另一个说。
“快从这里滚开”第三个说。
小家伙像是要说什么，但是最终还是什么都没有说。三兄弟见他不做声，纷纷向他发起攻击，额，扔蘑菇。
小家伙犹豫了一下，并未发起反击。反而跳进小河里，任凭河水将他带走。
在河流的下游，小家伙上了岸。抖抖身上的水，一副无精打采的模样往前走，口中呢喃：“为什么，我会在这里，没有人愿意接受我，谁也不需要我，为什么”。
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“方舟计划，由我们皇家骑士来执行，真的没问题吗”红莲骑士兽说。
“这不是可不可以的问题，这是世界树的决定。完成世界树的命令，是我们的使命”奥米加兽说。
“这样真的可以么？”
“你什么意思？”
“我们正在酿成大错，不是么？”
“你想说，世界树的决定是错误的么？”
“数码危机我很清楚，但是对于世界树执行的X程式，我实在不能苟同。”红莲骑士不赞同的说。
“持有X抗体的数码兽都是异分子，异分子必须遭受毁灭”奥米加兽说完便离开了。
他们跟我们，作为数码兽来说，有什么不同呢？红莲骑士兽低语道。
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凌云飞感到不对劲了，这一路走来遇到的数码兽实在是太少了。究竟发生了什么。
凌云飞跟着多路兽，来到了一个峡谷的上方。
峡谷的下边，两拨人正在对峙着。一个是拥有翅膀的鸟人型数码兽，一个是机械兽。另一边有一个向日葵兽还有一个机器人兽。还有一个幼生期的迪哥兽。
从这里看去，能够叫出名字的只有‘战斗暴龙兽，’。看样子是作为和事佬的存在，但是看情形似乎没有谈妥。因为，他在两方之间划了一个裂缝。
“现在不是争论的时候，这样下去所有的数码兽都会被消灭的。所有的一切都是世界树执行X程序所导致的。你们只知道片面的，世界树执行了X程序之后，他们将消灭所有拥有X抗体的数码兽，之后X程式将会充斥这个世界，换句话说，世界树已经成为我们所有人的敌人了！”数码暴龙兽解释道。
“哈哈哈，你的观点很有趣。但是我们不敢兴趣，我们来的时候已经向世界树请示过了，最终被消灭的，会是你们。”
正在两方人员僵持不下之时，奥米加兽出现在山崖之上。
战斗暴龙兽说：“快逃”。
鸟人型数码兽跟那个变成飞机的机械数码兽连忙飞离开来。奥米加兽的右手举起，一个光束炮像是要将天地分成两半的气势发射出去。虽然有战斗暴龙兽的阻挡。但是还是将那两个数码兽消灭掉了。
然后奥米加兽飞下峡谷，用左手的剑发出一道剑气，将那个机械人兽跟向日葵兽杀死。只剩下迪哥兽在瑟瑟发抖。
奥米加兽向迪哥兽发*一个光束炮。被战斗暴龙兽的身体承受。他护住了迪哥兽，身体却想着这边飞来。
“轰”的一下，撞到岩石上。迪哥兽在他身边叫他。
多路兽来到他的面前，战斗暴龙兽承认他是他的同伴，并拜托他在他回来之前好好照顾那个小家伙，然后就离开了。
奥米加兽也紧随其后。
“那是……皇家骑士？为什么出现在这里。”然后转头对咬住自己尾巴的小家伙说：“很痛的”。小家伙随即松了嘴巴。
之后，凌云天暗中保护着两个小家伙来到了一个类似于神庙遗迹的地方。好吧，是跟着小家伙来的，看样子，小家伙准备在这里等待了。
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另一边，战斗暴龙兽跟奥米加兽的对决，以奥米加兽的完胜而结束。奥米加兽正要清除掉战斗暴龙兽的时候，红莲骑士兽发来消息说世界树让他撤退。
奥米加兽便离开了返回到世界树所在地。
与金甲龙兽、红莲骑士兽，三人展开会议。但是奥米加兽并未听从红莲骑士兽的说法，固执的认为世界树是正确的。与此同时，世界残存的拥有X抗体的数码兽组成了联盟准备与皇家骑士团对抗。
“皇家骑士团非常强大，我们真的要与他们为敌么？”机械加鲁鲁兽问。
“笨蛋，如果不是，那你现在看到的又是什么？”受伤的战斗暴龙兽没好气的说。
“皇家骑士团无条件的遵从世界树的命令，我不认为他们遵从了自己的意志。这并不能解决问题啊”
“如果事情真的如你所说，那样就糟糕了。如果主控电脑利用那个破石头要将所有的数码兽解决，皇家骑士遵从的话就麻烦了。究竟是什么原因，让受数码兽尊敬的皇家骑士团变成现在这样呢”战斗暴龙兽不解的道。
“这个……即使这样……我依然相信他们。不管世界树在计划什么阴谋，我们很快就会知道了”机械加鲁鲁兽道。
夕阳西下，多路兽在跟迪哥兽玩耍，突然间大地开始震动起来。
两只数码兽躲在草丛里看着成千上万的数码兽从山上奔驰而下，可是，一道亮光充斥了两兽的视线，然后瞳孔不约而同的睁大，那些数码兽竟然全部----死去了。
浮在半空中的，赫然就是----奥米加兽！