黑洞作战第二阶段正式开始，庞大的舰队由两艘伪装成太空怪兽的战神号率领，向着西伯斯星系进发。
柏拉图向所有战舰发出作战命令：“本次作战分为三个阶段：第一阶段，两艘战神号提前1小时率先到达西伯斯星系外围，预先清理出一片空间给大部队冲出亚空间时使用，同时侦查太空怪兽的数量和分布；第二阶段，大部队到达西伯斯星系外围，与战神号会师的同时开始向着西伯斯星进发，预计这期间会受到太空怪兽的热烈欢迎，同时也是伤亡最大的阶段，按照预定计划，将于6小时到达目标区域，黑洞炸弹将会提前5分钟开始第二次缩退。第二阶段会随着前进速度调整，但是正负不超过1小时；第三阶段，黑洞炸弹在到达预定位置前开始第三次缩退，时间70秒，所有幸存的战舰全部在第三次缩退40秒后进行空间跳跃脱离战斗区域，不能进行空间跳跃的战舰将和战神一号一起保护黑洞炸弹最后30秒的缩退过程，击毁所有靠近黑洞炸弹的L级以上的太空怪兽。下面进入第一阶段，10秒后开动超速引擎。”
两艘战神号同时从舰队里消失。
就在战神号在亚空间里航行到第二天的时候，警报器响了。
张正树等人正在睡觉，听见警报都立刻爬起来，拿着衣服边穿边跑向舰桥。“司令，什么情况？”
“有太空怪兽？”柏拉图也将信将疑。
“什么？太空怪兽？我们到西伯斯星系了？我不会睡了五天吧？”
“不是，我们在亚空间。战神号，重新扫描目标。”
“是！……扫描完毕，目标类型，太空怪兽，数量，一，级别，XL。预计接触时间，5分钟。”
“怎么会在亚空间遇到这怪物？司令，我们没有亚空间的作战经验，战神号在这种情况下能开火不？”
“应该能，如果不能，我们可能会被撞散架，不过开火后，伪装效果会大幅降低。战神二号，我们先将它击毁，你们用空间转移炮将其尸体移走。”
两艘战神号在几分钟时间内连续开火多次，终于将这只大型太空怪兽解决。
“这家伙到底为什么会出现在西伯斯星系到太阳系的亚空间通道里？”
众人想了很久，最后刘星星恍然大悟：“我知道了，你们还记得我们几天前杀死的那只突变的太空怪兽吗？它死之前发出了脉冲信号，可能就是它把这个大家伙引来的！”
“好像是有这么回事，”柏拉图若有所思，“当时大家都只顾着高兴了，没有把这个细节放在心上，刘星星不愧是搞研究的，很注意细节。”
“要不然怎么能当天使军团的所长，哈哈！”张正树拍了拍刘星星大笑。
“幸亏我们将其在亚空间里干掉了，如果让它到了正常空间，里面小的就难以清理了。而且，这只应该是奔着地球去的，到时地球会……”
“所长，为什么在亚空间就行？我们也没有确定把里面小的全部清理掉了啊。”
“小的都不具备空间跳跃能力，我们干掉了大的太空怪兽，小的应该会死在亚空间。”
战神号继续在亚空间航行，终于快到西伯斯星系了，众人都做好战斗准备，迎接大批太空怪兽，不过当战神号从亚空间出来的时候，众人还是大吃了一惊。
周围全是M型以上太空怪兽，雷达上已经数不清，战神号报告目标数量超过21亿，由于数据范围限制无法跟踪更多的目标。
柏拉图在战神号的雷达成像上又发现了一个更惊人的情况：西伯斯星系现在就是一个巨大的太空怪兽基地，这个巨大的基地以西伯斯星为中心，延伸成比原先的西伯斯星还大两倍的巨型物体，从山杜卡提供的西伯斯星系的资料来看，西伯斯其他的行星都已经消失，由这个巨型基地围绕恒星旋转。
“我的妈呀，这玩意有多大啊？”张正树掉了下巴。
“直径超过3万公里。”柏拉图依然镇定，“我推测，这个基地本身就是太空怪兽的母体，是太空怪兽在银河系的大本营。”
“那个空间隧道就在这个母体内部。”刘星星补充了一句。
“太空怪兽还没有发现我们的迹象，战神号，全隐形模式前进，机师们保持一级戒备状态，随时准备出击。”柏拉图司令下达了命令。
两艘战神号无声无息前进着，使用低速压缩空间航法，可以在半小时内到达大部队的预定出现区域，到时先头部队有半小时的时间清场。
不过，太空怪兽似乎比想象中聪明得多，它们在慢慢包围两艘隐形的战神号。
“太空怪兽已经发现我们了。”柏拉图看着雷达道，“它们在摆阵势，渐渐包围我们。”
“它们怎么能探测到我们？”很多人不理解，柏拉图也转头看着刘星星。
“它们既然能有如此高的环境适应能力，其感觉应该也是相当敏锐的，战神号虽然进入隐身状态，不过由于其质量很大，引力不能忽略不计，估计太空怪兽是靠引力来感知大型物体的。而且，隐形装置经过亚空间的战斗已经没有什么效果。”
“原来如此，很有道理，”柏拉图立刻下达指示，“以现在的速度，还有10分钟就能到达目标区域，我准备在离目标区域两千公里处停下，等待时机，如果太空怪兽涌了上来，我们就开打，如果它们没围上来，我们就留下湮灭炸弹，等到大部队快到的时候再清场。”
随着战神号的进发，太空怪兽的密度越来越高，体积也越来越大，不过依然没有主动攻击，形成了越来越厚的包围圈，等到战神号停下时，包围圈也停下，双方继续对峙。
战神号收到来自太空怪兽发出的某种亚空间信号，不过无法翻译，弄不明白。
于是继续对峙……
“距离预定时间还有2分钟，湮灭炸弹情况如何？”
“情况良好，似乎太空怪兽没有注意小型物体。”
“湮灭导弹改为遥控引爆模式，向前方空隙发射六枚，接收器延时50秒后启动。”
“导弹已发射，太空怪兽没有动静。”
“距离预定时间还有1分钟，预定区域仍然有太空怪兽活动，湮灭炸弹将于15秒后引爆，预计电磁脉冲将于30秒后到达！”
一阵刺眼的闪光过后，目标区域的太空怪兽消失了，十几秒钟后，大部队按预定结束空间跳跃，出现在目标区域。
战神号在电磁脉冲后立刻向目标区域发射信息，因此米姬丽等人刚结束空间跳跃就收到了战神号发来的信息。
“按预定向西伯斯星前进，西伯斯星系现在只有一个太空怪兽的基地，其他行星都已经不存在。随时做好战斗准备。”
所有舰队顺利会师，太空怪兽仿佛受到了电磁脉冲的冲击而在这段时间内并无明显活动。
“看来这一招挺管用。全舰队准备进入第二阶段作战，15秒后引爆湮灭导弹，战神号以外的舰船做好电磁脉冲预防准备，预计55秒后到达！”
第二次闪光过后，前方太空怪兽又消失一大片，太空怪兽依然没有动静。
“全舰队以最快速度前进。”由于沙漠级和勃密尔战舰比战神号速度慢很多，所以战神号仍然先行开路，直到湮灭导弹用完，第二阶段已经进行了3个多小时，进度还算顺利，不过，太空怪兽已经渐渐开始活动，接下来要短兵相接了。