没人能说得清楚鸟居究竟是何时确立的，具体不会早于公元六世纪，大致是在日本处于和铜（元明天皇）时期，作为日本本土反异民力量的神佛习合组织才进入仙道众的视野；同时随着中日两国交流逐渐加深，仙道众本体对日本反异民势力的影响也愈来愈大；最终，在仁和三年（公元888年），日本反异民势力借鉴了仙道众的组织形式和军事管理方式，以日本神社最标志性的建筑物——鸟居为名，建立了集中的反异民组织，并成为与仙道众的一部分。
鸟居由于远离仙道众核心，自加入仙道众一来一直是仙道众的异类。他们对待部分敌对异民凶残无比，对待部分异民有若神明，这种举动引起了其他仙道众部分的反感甚至是敌视。自公元888年加入一来，鸟居退出仙道众已有十余次，绝大多数都是因为在针对异民的方针上与其他仙道众组织出现分歧导致。鸟居也与大陆仙道众发生过数次战争，由于隔着海洋，双方皆为取得什么显著战果，最终都是在协商后恢复和平。
与其他仙道众组织不同，鸟居的主要构成部分为日本各大里世界家族，诸如神代家、橘家、安.倍家、贺茂家、吉川家；在成立鸟居后，便形成了以神代家为核心，其他家族鼎立拥护的政.治.局面，这种政.治局面一直到仙道众同治改革也未见有何变动。古时鸟居领导人为大神官（极少）或神代大巫女，在同治改革后为鸟居评议会议长，同样由神代家世袭。最高领导人要求身着紫胯，凤纹千早出席正式场合，但最新三位议长神代茉莉子、神代百合子和神代千夏拒绝此服饰。