始祖病毒的扩散开始向着动物，植物传播，西城的人们不得不开始被迫消灭一些进入了西城区域的感染者，从而彻底将西城保卫下来，这段时间木西加入到了清理小队之中，负责将那么感染者的尸体通过吞噬空间魔法净化掉，但是木西发现每次的净化，都有一种能量灌注到木西的身体中，由于魔鳞刺青的影响，似乎没有对自己造成怎样的影响，清理工作有条不紊的进行的同时，南，东，北城已经彻底沦为始祖教派的领地。
始祖教派让那些散步在星际各种的感染者全部迁徙到这里，其目的是守住终于得到的领地，在几百星球中，魔法传送阵开始了无休无止的工作，没一分钟，木西所在的星球就会有一百个感染者出现，而这些悍不畏死的士兵将西城整个包围，庆幸的是少量的飞行生物还无法对西城构成威胁，在埃克斯的魔法能力的施展下，西城的每一座建筑物都带着魔法攻击力，只要接近的感染生物就会马上被一座座防空炮一样的魔法建筑碾成灰烬。
而在清剿过程中，清理队也带回了不少活样品提供给北城技术人员进行研究，南城善于空中作战，所以对空单位的事都交给了南城城主安排，北城属于科技科研城市，对于这些感染生物有着最具资格的研究权利，埃克斯的魔法城间接的被感染者间接（被自己直接）毁灭，所以现在发言权最弱的就是埃克斯，福尔维尔被临时任命为魔法城副城主一职，木西，米斯多被任命为魔法城审判长和魔法城外交执行官，然而木西的职位，现在来说可有可无，米斯多和福尔维尔现在还有一定的发言权利，木西只有自己找事做了。
通过两个星期的净化行动，西城的动植物也算是保住了，因为北城科研人员的不断努力，始祖病毒净化药剂已经开始进入批量生产阶段，而希尔斯的清洁工具仪器在这次始祖教派防御中起到了很大的作用，不仅成为了净化西城森林区的魔能机械工具，而且通过希尔斯的清洁工具仪器使得无休止的感染者得以解脱，在清洁工具的缘由基础上，北城科研人员改造出了地下清洁魔能机器人，空中净化魔能机器人，挽救回了不少因为感染而不受控制的人民们。
被挽救的人民们被至于隔离区暂时保护着，然而药剂的效果并不是一直有效的，一段时间之后又再次失去了效果，感染者大军继续攻击着西城，由于西城得天独厚的环境，人们的物质供给充足，也没有出现太多的伤亡现象和感染现象的发生，而希尔斯的贡献可以说是功不可没的，在埃克斯的下，希尔斯得到了由公民身份进阶为爵士身份的奖励，因为希尔斯出于魔法城，也给了埃克斯有了一点稍微能够站稳脚跟的地方。
在几个月继续防御的过程里，西城中不断研制新型药剂，始祖病毒也开始不断的进化着，始祖教派的攻击依旧没有停止的意思，源源不断的攻击，让战斗人员在新药剂研发之后抓紧时间休息一下，又继续投入战斗之中，而且因为药性的逐渐减弱，战斗人员的休息时间也越加减少，于是通过艾诺斯王国八个（八个方向城市）城主的商议后，决定由埃克斯带领一批特种战斗人员去斩断始祖教派的人员传送阵，埃克斯对这个提议无可厚非，带上木西就离开了。
这段时间的战斗中，木西的魔法也都纷纷得到了进阶，威力也逐渐的加强，在东城时施展的全系魔法融合而出的魔法攻击，更是赢得了所有战斗人员的赞赏。埃克斯临走时已经交给了福尔维尔和米斯多，关于自己的遗嘱，而木西其实根本不知道为什么就被埃克斯弄走了。
夜晚，密密麻麻的感染者大军向着西城不断走去，而水中有两道透明的身影向着这些大军的后方游去，在整套华贵而高级的装备帮助下，两人很轻松的避开了那些没有思想的家伙的注意，一路来到了魔法传送阵所在地，埃克斯示意木西去破坏其中一个，而自己开始使用不断输出魔能从而隐藏木西和自己的身形的魔法，木西将手在空中刻画了几下，远处的一个魔法阵就像是负荷工作了一般，停止了战斗人员的传送。
然后两人就趴在地上看着魔法传送阵地的情况，一分钟，一分钟之后，那个魔法传送阵能够正常运转，继续产生那些悍不畏死的怪物，“超强恢复力的建筑物？”埃克斯的声音仿佛是中了大奖一般。
随后，传送魔法阵开始出现诡异的灰色光芒，建筑物们开始攻击那些感染者大军，感染者大军们却依旧出来了之后就往西城方向走去，哪怕有的被魔法建筑打得一瘸一拐的，然后因为速度的问题，被其他的士兵活活踩死在脚下，虽然攻击力不佳，但是却让传送阵地造成了科技时代人们最害怕的现象，堵，由于把一些怪物的速度减慢了，于是怪物们渐渐堵塞在了传送阵地中，越发难以顺利的疏通出去，同样这是木西和埃克斯也准备好了战斗，都闹成这样了，BOSS如果还不出现的话就实在是太不称职了。
穿着暗绿色的制服的始祖教派成员出现，先是被埃克斯的魔法建筑狂轰了一阵，无奈破坏了魔法传送阵之后，暂停了人员的输出，而木西早就准备好的七系魔法想一颗手榴弹一样扔进了始祖教派的成员之中，让这些成员还没惨叫便化作了魔法元素消失在了空气之中，埃克斯收回了控制魔法传送阵的魔法，随手一挥，一个巨大的传送门出现在上空。
一架架载满了炸弹和火药的飞机纷纷出现在传送阵的上空，扔下的一枚枚炸弹把传送阵地打得颓败不堪，南城的飞行兵种加上北城的科技火力，就这样在天空之中飞舞了一天一夜后，在此回到了传送阵中，回到了西城，留下了埃克斯和木西两人，和这些废墟一般的传送阵地，埃克斯看了看天空，又刻画了几个魔法阵一个个没入了木西的脑海之中，对木西说道。
“这几个魔法可以把艾诺斯王国夺回来了，我现在需要去查明始祖教派的藏身地，然后通知树族和羽族进行永久性的清剿，你现在继续前往其他地方破坏传送阵，并且，我不在的时候，魔法城就交给你了。”说完，埃克斯便向天空飞去，越来越快，直到化作了一道耀眼的流光。
“啊？”木西愣了一下，“你特么什么都不跟我说，现在说完就走！？”木西看了看埃克斯消失的地方，不禁叹了一口气，分身化作六个，分别前往不同方向的主城而去，六个木西，有的通过水魔法，有的化作风魔法，有的进行时空跳跃，各自施展不同系魔法的赶路功能，不久之后便离开了这里。