放走了蕊儿的亲妹妹，朱由检对剩下的白莲教徒可不再客气了。近百名特战队员一涌而上，先把所有香客赶出香积寺，然后一个房间一个房间地搜寻，最后搜出几十个假和尚，还从密室中救出十余名被囚禁的女子。
这时戚美凤和李贞妍也扶着蕊儿走出密道，很多天不见天日的蕊儿此刻脸色更显苍白，见到朱由检，不停地流着泪道：“王爷，蕊儿不该瞒你！我…”
朱由检却根本没有责备蕊儿之意，暖暖地一笑道：“好了好了，只要你没事，为夫就放心了。咱们现在马上回家，让玉怜给你瞧瞧，你再好好睡上几天，有什么事以后再说。”
一行人随即押着这伙白莲教徒，护送蕊儿返回秦王庄。朱由检赶紧请来包玉怜，一边简单向她介绍事情的经过，一边让她为蕊儿号脉。此时蕊儿已经昏迷不醒。
包玉怜当然也大吃一惊，仔细为蕊儿号过脉后蹙眉道：“王爷，娘娘服用的是一种毒药，此毒早已随气血运转全身。虽然于性命无碍，但可使人全身乏力，精神倦怠，整日昏昏欲睡。要想疗毒也并不难，只是需要时日。如是春夏季节，大约需要一个月；秋冬季时间要更长一些，至少也需三个月才能复原。在这段时间里，玉怜须得每日为娘娘金针过穴，娘娘在此期间绝不可有剧烈运动，也不可耗神。”
“玉怜，那就辛苦你啦！”朱由检感激地道。
从蕊儿的房间出来以后，朱由检立即赶往监狱，严振纲正在那里审讯那些假和尚。一进牢房，并没有他想象中的血腥残酷场面，严振纲已经审完几个，并将签字画押的口供呈给朱由检过目。
朱由检不禁对严振纲笑道：“都管你叫‘活阎王’，这次怎么没有用刑？”
严振纲永远是那副不苟言笑的样子，认真地答道：“启禀殿下，臣以为用刑只是手段而不是目的，如能通过其他方法得到口供，查清案情，也就没有必要用刑。前面审的这几个白莲教徒，都是些稀包软蛋，一问就招了，因此臣也可以留着些力气，审那些负隅顽抗的罪犯。”
朱由检大略看了看那些口供，见这些白莲教徒果然是以那名护法为首，将香积寺原来的和尚都抓起来押到别处，他们在这里当起了假和尚。除了侵吞香火钱以外，更哄骗和诱拐了十余名良家妇女，囚在寺中。但是那护法上面还有什么头目，他们就不知道了。
朱由检看罢大怒道：“看来这白莲教果然是邪教！单是糟蹋妇女这一项，这些人已经全是死罪了。严振纲，对他们不要客气，一定要严加审问，最好连他小时候偷邻居家鸡蛋的事都审出来！”
从监狱出来以后，朱由检又立即密召燕凌和解胜议事，并开门见山地道：“白莲教乃是邪教，且囚禁娘娘，欲对本王不利，必须狠狠打击。按理说这事该由朝廷和官府管，但据说白莲教和官府中人勾结甚广，指望着他们恐怕什么事也做不成，本王只好越俎代庖！你们商议一下，看看该怎么行动？”
这两员骁将登时来了精神，你一言我一语地探讨起来，很快就拿出一个方案：鉴于白莲教在西安附近各府县都有分布，虽然香积寺这个窝点被打掉了，但一时之间其他香坛还得不到消息，可能还会公然传教。因此可以马上派出几十支小分队，化装成平民接近香坛，然后以迅雷不及掩耳之势拿下那些骨干分子。至于那些信众，多是无知愚民，抓不抓意义也不大。只有西安城内的白莲教，因为现在西安还在戒严，除非再来一次突袭镇守太监府那样的行动，否则只能暂时忍耐。
朱由检听罢立即拍板道：“事不宜迟，你们立即行动，明天就把人抓回来，西安城内暂时不要管他。记住，能多抓就多抓，咱们秦王庄的监狱现在空得很，城内也正缺苦力呢！”
不过一天时间，几十支小分队纷纷凯旋，抓回来近千名白莲教徒。有些香坛的“护法”不过是些地痞流氓，秦兵一亮家伙就吓尿裤子了，抓捕他们也没费吹灰之力；有的则仗着自己有些武功，想要拒捕，秦兵也毫不客气，上来就是一排鸟铳齐射。那些被蒙蔽的信众，一见平时自诩“刀枪不入”的护法被打成了筛子，这个事实可比什么说教都管用，当即跪倒连连求饶，保证以后再也不轻信邪教了。
人抓回来以后，朱由检亲自陪着严振纲审讯，主要是筛出其中的骨干分子，并摸清白莲教的内部组织脉络。几天下来，他已经初步了解到：白莲教体系庞大，教众遍布全国。最高首领为“教主”，亦称“尊者”，自称是弥勒佛转世，法力无边。
仅次于“尊者”的是“圣母”，但这个“圣母”绝少露面，从来没人见过。“圣母”之下，就是“圣女”，一共有四名，像蕊儿的妹妹蕾儿就是其中之一。
这三种身份，算是教内“圣神”，凡教徒皆要每日遥拜。而在教内实际负责管理的叫做“金刚”，无一不是身负绝学的高手；“金刚”之下则是“护法”，也就是每个香坛的头目。仅西安附近，就设有几十个香坛，全国还不知道有多少，教众的数目更是不下百万。
而白莲教的“教义”，则是鼓吹如今已是“末世”，只有尊拜来世佛弥勒佛，才能免遭天谴。待信众被忽悠得深信不疑后，则要求他们捐出一切家产，完全供“尊者”驱策。至于“尊者”到底要他们做什么，甚至这个“尊者”姓甚名谁，长得什么模样，就连这些“护法”也不知道。因为教中鱼龙混杂，心性奸邪之人为数不少，类似香积寺的情况非常普遍，而那“尊者”也听之任之。
审了半天，最关键的首脑一个也没审出来，朱由检不禁有些沮丧。看来这白莲教组织严密，绝非一日可除，与他们的斗争恐怕会持续很长时间。
一天他刚看过厚厚的卷宗，疲倦地揉着太阳穴，石彪匆匆进来禀报道：“殿下，娘娘醒了，急着要见您呢！”