在调取刑部卷宗的这段时间里，温体仁成了众矢之的。以李标、钱龙锡为首的数十名东林系大臣对他万炮齐轰，均说当年钱千秋之事闹得满城风雨，最后都知道钱谦益是被人陷害。此事已有公论，温体仁这时翻出来这段旧案，显然别有用心。
尤其是吏科都给事中章允儒，他属于东林党中的强硬派，一向主张排挤非东林系大臣。为了反驳温体仁，他出班抗声奏道：“此事当年尽人皆知，犯人供状曾刊于邸抄，臣亲眼看过，记忆犹新。明明已经结案，温体仁硬说没结，搅乱枚卜大典，其罪非轻！”
温体仁虽然势单力孤，却是毫无惧色，以不变应万变，一口咬定此案未结。他连连向朱由检叩头道：“臣若是信口雌黄诬告钱谦益，那就是欺君之罪，务请陛下诛戮以昭示天下；可臣若说的是事实，是不是就证明钱谦益确实有党？”
朱由检见温体仁有恃无恐，料想他必定抓住了此案的纰漏之处，便让众臣暂停议论，等案卷来了一看便知。
须臾卷宗调来，朱由检亲自审阅。只见卷宗中附有钱千秋当年的试卷，每段的末字果然是“一朝平步上青天”。再看犯人的招供，倒是确有徐时敏、金保元、钱千秋三人各自的供状，上面都有血红色的指押。而且三份供状内容相同，都称钱谦益与此案无关，只是徐金二人打着他的幌子骗人。
朱由检心中狐疑，心想自己虽然不喜欢钱谦益，但也不能制造冤假错案啊。便将案卷掷与温体仁，冷冷地道：“你说此案未结，这不是已经结了么？”
温体仁恭敬地拾起案卷看了两眼，便不慌不忙地道：“陛下请看。钱千秋的试卷有两份，一份是他本人答的原卷，一份是经过誊录的。请陛下与诸公对比原卷和供状的字迹，是否相同？”
朱由检心中一紧，忙接过试卷再细看，果然两者的字迹不尽相同。朱由检心念电转之间，已明白此中必定有鬼。但温体仁肯定没看过卷宗，他又是怎么知道的呢？
温体仁马上为众人揭开了谜底：“臣与钱千秋同为浙江人，此案在刑部审讯时，臣在浙江的故友曾亲眼见到钱千秋游西湖，根本没在京师。人都没来，这供状难道是长翅膀飞来的不成！”
此言一出，满朝大哗。钱龙锡、李标、乔允升等人依次传阅卷宗，发现确如温体仁所说，也全都傻了眼。朱由检便问乔允升：“你是刑部尚书，你说这是怎么回事？”
乔允升当即冒汗道：“回陛下，虽然案发时臣未在刑部，但到任后未能查出此弊案，臣有罪！当时经办此案者，乃是时任刑部尚书田吉，很有可能是田吉收受了某人的好处，才故意宽纵钱千秋。只是现在田吉谋逆已经伏诛，死无对证…”
温体仁当即跟上一句道：“田吉虽死，钱千秋仍在。将他收监重审不就行了？”
此时白纸黑字，东林系大臣虽想袒护钱谦益，却是无话可说。良久，钱龙锡缓缓地道：“既然钱谦益与此案有涉，案情未清之前，确实不可再入阁，请陛下另选他人。”
众臣一听，钱龙锡这是要丢车保帅了。还有人想为钱谦益出头，但见钱谦益面如死灰，抖衣而战，均知道他肯定不干净。皇帝年纪虽轻却明察秋毫，这一关他肯定是过不了了，因此也只得纷纷附议。
朱由检心中暗喜，本来他就讨厌钱谦益，正好借这个机会道：“既如此，暂将钱谦益革职，待审清此案后再做区处。”
这下可好，钱谦益满怀热望，风尘仆仆地赶来京师，又上窜下跳四处串联。最后不但没能入阁，连现有的官职也被撸了。当即有警卫团军士上前摘了钱谦益的冠冕，将他“送”出殿外。
本来此事就算告一段落，可温体仁仍不肯善罢甘休，继续叩头奏道：“钱谦益如此人品，竟得朝臣共推，可见结党营私，请陛下严查！”
这下东林党人可不干了，心想你温体仁好大的胆子，得了便宜还卖乖，竟敢单枪匹马向整个东林党挑战？
于是钱龙锡、李标、乔允升、刘鸿训等重臣纷纷表态，言推举钱谦益实出于公心。至于钱千秋案，众人确实不知情，但绝无结党营私之事。
尤其是章允儒，刚才全力维护钱谦益，没想到钱谦益自己不争气，让他顿觉下不来台，正无处撒气，便将怒火全倾泻到温体仁头上，指着他的鼻子怒喝道：“枚卜大典，天日临之于上，诸臣何敢营私？你虽然为官资历深厚，但素无清望，诸臣就是不推举你，你待怎的？还有，你既知钱千秋一案有鬼，为何早不奏晚不奏，偏要等枚卜选中钱谦益时才告发？可见你就是想扳倒钱谦益，自己进入枚卜名单！我告诉你，似你这等私欲熏心之人，钱谦益倒了，也轮不到你！”
温体仁却早有准备，好整以暇地道：“有理不在声高，章大人你吵嚷什么？你喊得越欢，就越证明你是钱谦益一党。你问我为什么不在枚卜之前参奏？嘿嘿，钱谦益若不入内阁，不过是一吟风弄月的闲官，参他何用？正因为他想挤入内阁，而陛下乃千年一出之圣君，用人自要慎之又慎。所以我才宁肯与满朝大臣为敌，也要参倒这个奸佞无耻之徒…”
“你说谁结党？”章允儒不等温体仁说完，暴怒地打断他道，“党之一事，从来小人构陷君子，都是这等说！陛下，臣犹记当年阉贼魏忠贤驱逐赵南星等公忠之臣，也说结党，尽行削夺。大抵小人为公论所不容，便将众望所归者指斥为党，留传至今，为害君子之榜样！”
他这番话一出口，温体仁却是展颜微笑。而钱龙锡、李标等人则是摇头叹息，暗道章允儒好不谨慎，怎能拿皇帝与魏忠贤相比！
果然，朱由检当即冷笑道：“哦？照你这么说，魏忠贤以结党为名罢了赵南星的官，今天朕罢了钱谦益的官，朕和魏忠贤是一丘之貉了？”
章允儒当即语塞，朱由检就势瞋目大怒道：“君前奏对，何敢如此放肆？警卫团何在！”
燕凌等警卫团军士当即应声而出，朱由检咬牙道：“将章允儒押下去！”