接下来云林派遣一个分魂押着那断腿的大汉回到皇宫，而云林自己则与大国师一路闲聊着回到皇宫，顺便将自己在洪蒙境及如何回到山阳城的经历简要地向大国师介绍了一番，只是对山洞中获得功法典籍等事略而不谈，只说自己糊里糊涂地就回到了山阳城。
鉴于自己的分魂大部分已经出来活动，云林倒也没有隐瞒自己修炼有魂诀之事，并向大国师坦承了太真魂诀无法传授他人，让一时心动的大国师慨叹不已。
随后二人回到皇宫之后，立即对那断腿的大汉审讯，得知了蓝山谷在云台城中布置的一些据点，由云林派遣分魂前去清剿干净，其间云林的分魂顺带控制了一些蓝山谷潜伏的人员，通过这些人的记忆进一步了解了蓝山谷的布置，不到一天功夫，就将蓝山谷在云台城的人员全部搜捕殆尽。
至于被蓝山谷黑衣人破坏的北城，则由朝廷拔款，足足用了三天才重新修筑成功。待到第三天事情大定之后，鉴于云林此次剿灭扶由帝国的大功，皇帝亲自下令，封云林为护国大将军，并将山阳城及其附近十万余里范围赠送给云林作为封地，并在云林要求下，特予云家子弟自由出入真灵谷。
接下来云林将颠倒阴阳阵的布设诀窍传给了大国师，并由大国师传授给真灵帝国各处守军，并令各地守军加速训练。一月后，已经能够布设颠倒阴阳阵的真灵帝国大军由云林百位分魂带领，兵发扶由帝国。扶由帝国的真觉境强者几乎在云台城一役中陨落殆尽，只留下一个真觉境将领镇守国中，遇到了实力相当于真觉境的云林百位分魂后，终于不敌，被云林一个分魂吞噬了魂珠，成为云林的一个真觉境肉身分魂。
而云林分魂带领的大军，以颠倒阴阳阵辅助，所过之处，扶由国一个个城池望风而降，不到一个月时间，整个扶由国全部落在了真灵帝国手中，扶由国皇室人员除了少数提前逃到了其他国家外，大部分被俘虏，而云林的分魂也趁机将扶由国皇家财宝及镇国功法典籍搜刮一空。
在云林百位分魂率领大军横扫扶由国之时，大国师却在国师府中向云林传授真龙诀的各种武技，足足一个月后，待到云林将真龙诀各种武技完全掌握后，大国师立即再次闭关。半年后，大国师破关而出，却已然是真觉境中期，寿元增加了六百载。
在此期间，云林通过与飞林镇的分魂灵魂共享，向云家弟子传授了各种功法武技，并将云雷及弟弟及一干修炼有成的十名云家弟子送入了真灵谷，由于有弱水女神提供的真灵谷资料，云雷等人进入真灵谷后，各自依照所炼功法寻找到了对应的真灵，顺利与真灵融合后又被传送了出来。
多出了十二名真灵融合后的弟子，加上云林大量天品丹药供应，又半年后，云家多出了十二名真元境，十二人尽皆是六品金丹以上的高品真元境，真元初期实力就堪比普通的真元境后期修者，云家实力直逼真灵帝国四大宗门。
半年后，当云林百名分魂从扶由帝国凯旋而归后，真灵帝国在云台城举行了盛大的庆功会。庆功会后，云林正要返回国师府，一袭香风扑面而来，一道倩影一闪地拦在了云林身前，赫然正是崔燕。
“云林！如今你已经是真觉境强者，现在帝国大局已定，燕姐请你帮一个忙，若是此事办成，以后本姑娘保证，再也不扭你的耳朵了！若是不成，哼哼……”崔燕看着正要离去的云林，柳眉一竖，半是恳求半是威胁道。
“好！燕姐且说，只要燕姐答应不再乱拧耳朵，就是上刀山下火海我也愿去！”云林闻声大喜地点头道。
“云林你如今实力已经达到真觉境，并且你的魂诀也是不弱，还请你帮忙寻找家父下落！”崔燕闻言喜极而泣地向着云林盈盈一礼道，吓得云林连忙将其扶起，答应了下来。
随后崔燕将父亲的画像交给了云林，并将其父亲的修为强弱，以及在哪里失踪等信息一一向云林说知。云林将情况了解清楚后，向崔燕好好劝慰了一番，然后心念一动，将崔燕父亲相关信息与所有分魂共享，而后一声令下，云林魂之空间中三十六个真觉境实力分魂一哄而出，朝着真灵帝国及附近数十个国家激射而去。
云林自己没有出动，而是让众分魂以广及百余万里的灵觉在天下四处搜寻，自己则回到洞府中继续修炼，将在迷宫山洞中得到的各种功法取出一一参悟修炼，云林赫然发现山洞中得到的功法，每一门功法威力都堪比生生功，让云林初步修炼下，法力大增，短短一年间，修为就达到了真觉境中期。
在此期间，云林的太真魂诀，青帝体功正式突破到了第七层，如今云林魂之空间中刚诞生的新魂丝，魂力就达到十级魂体，实力堪比真觉境初期修者，而体功的实力已然相当于初灵境强者。
这一日，云林终于将山洞中得到的功法秘籍参悟完毕，无聊之余，再次取出了山洞中得到的《仙方集萃》，开始一页页地阅读下去，当翻阅到最后一页时，云林蓦然拍岸而起，一脸兴奋地欢呼道：“妙！妙！化仙丹方！竟然是化仙丹方！原来此书所写仙方并非虚妄之言，只是每一种仙方所须灵草矿石过于稀有而已。好在将此书重新阅读，否则小爷竟然要错过了这化仙丹方。”
随后云林将整本《仙方集萃》全部阅读完毕，依仗过目不忘之能，将秘籍中的内容牢牢记在了心里，脸上露出了甜甜的笑容。在秘籍中，云林终于找到了两种丹方，一种是自然是化仙丹，一种是铸体丹。这两种丹药所需灵草云林在洪蒙境中就已集齐，完全可以依照丹方炼制而出。