上皮细胞基部有短的底细胞，有人认为可以发育成柱状上皮细胞。
感觉细胞聚集形成感觉器，分散在上皮细胞之间，基部与上皮下的一薄层神经组织的神经纤维相连。此外尚有感光细胞，位上皮的基部，也与其下的神经纤维相连。
蚯蚓的肌肉属斜纹肌，一般占全身体积的40％左右，肌肉发达运动灵活。
蚯蚓一些体节的纵肌层收缩，环肌层舒张，则此段体节变粗变短，着生于体壁上斜问后伸的刚毛伸出插入周围土壤；
此时其前一段体节的环肌层收缩，纵肌层舒张，此段体节变细变长，刚毛缩回，与周围土摆脱离接触，如此由后一段体节的刚毛支撑即推动身体向前运动。
这样肌肉的收缩波沿身体纵轴由前向后逐渐传递。
体腔被隔膜依体节分隔成多数体腔室，各室有小孔相通。每一体腔室由左右二体腔囊发育形成。
体腔囊外侧形成壁体腔膜，内侧除中间大部分形成脏体腔膜外，背侧与腹侧则形成背肠系膜和腹肠系膜。
蚯蚓的腹肠系膜退化，只有肠和腹血管之间的部分存在；背肠系膜则已消失。前后体腔囊间的部分，紧贴在一起，形成了隔膜。有些种类在食道区无隔膜存在。
消化管纵行于体腔中央，穿过隔膜，管壁肌层发达，可增进蠕动和消化机能。消化管分化为口、口腔、咽喉、食管、砂囊、胃、肠、肛门等部分。
口腔可从口翻出，摄取食物。咽部肌肉发达，肌肉收缩，咽腔扩大可输助摄食。
咽外有单细胞咽腺，可分泌粘液和蛋白酶，有湿润食物和初步消化作用。
咽后连短而细的食道，其壁有食道腺，能分泌钙质，可中和酸性物质。食道后为肌肉发达的砂囊，内衬一层较厚的角质膜，能磨碎食物。
自口至砂囊为外胚层形成，属前肠。砂囊后一段消化管富微血管，多腺体，称胃。
胃前有一圈胃腺，功能似咽腺。胃后约自第15体节开始，消化管扩大形成肠，其背侧中央凹入成一盲道，使消化及吸收面积增大。
消化作用及吸收功能主要在肠内进行。肠壁最外层的脏体腔膜特化成了黄色细胞。自第26体节开始，肠两侧向前伸出一对锥状盲肠，能分泌多种酶，为重要的消化腺。
胃和肠来源于内胚层，属中肠。后肠较短，约占消化管后端20多体节，无盲道，无消化机能。以肛门开口于体外。
蚯蚓的消化系统由较发达的消化管道和消化腺组成，消化管道由口腔、咽、食道、嗉囊、砂囊、胃、小肠、盲肠、直肠和肛门等部分所组成。
蚯蚓很特别，如同它的身体分节而没有明显的归并那样，它的心脏也随身体前部的若干节分成了若干个，一般为4～5个，呈环状，好像膨大的血管，所以也有称环血管的。
环状心脏的背面接自后向前的背血管，腹面接自前向后的腹血管，腹血管还有分支连通着自前向后的神经下血管。
环状心脏比起血管来，肌肉壁比较厚，能搏动，里面还有单向开启的，保证血从背血管流向腹血管的瓣膜。
大体说来，靠这数个各自独立的环状心脏的搏动给血流以动力，血流的方向是自后向前（背血管中）、自背向腹（环状心脏）、自前向后（腹血管和神经下血管）。
蚯蚓的排泄器官为后肾管，一般种类每体节具一对典型的后肾管，称为大肾管。
环毛属蚯蚓无大肾管，而具有三类小目管：体壁小肾管位体壁内面，极小，每体节约有200～250条，内端无肾口，肾孔开口于体表。
隔膜小肾管位第14体节以后各隔膜的前后侧，一般每侧有40～50条，有肾口呈漏斗形，具纤毛，下连内脏有纤毛的细肾管，经内腔无纤毛的排泄管，开口于肠中。
咽头位咽部及食管两侧，无肾口，开口于咽。后二类肾管又称消化肾管。
各类小肾管富微血管，有的肾口开口于体腔，故可排除血液中和体腔内的代谢产物。肠外的黄色细胞可吸收代谢产物，后脱落体腔液中，再入肾口，由肾管排出。
蚯蚓为典型的索式神经。中枢神经系统有位于第3体节背侧的一对咽上神经节（脑）及位于第3和第4体节间腹侧的咽下神经节，二者以围咽神经相连。
自咽下神经节伸向体后的一条腹神经索，于每节内有一神经节）。外围神经系统有由咽上神经节前侧发出的8～10对神经，分布到口前叶、口腔等处；
咽下神经节分出神经至体前端几个体节的体壁上。
腹神经索的每个神经节均发出3对神经分布在体壁和各器官、由咽上神经节伸出神经至消化管称为交感神经系统。
外周神经系统的每条神经都含有感觉纤维和运动纤维，有传导和反应机能。
感觉神经细胞，能将上皮接受的刺激传递到腹神经素的调节神经元，再将冲动传导至运动神经细胞，经神经纤维连于肌肉等反应器，引起反应，这是简单的反射弧。
腹神经索中的3条巨纤维，贯穿全索，传递冲动的速度极快，故蚯蚓受到刺激反应迅速。
雌性生殖器官：有卵巢1对，很小，由许多极细的卵巢管组成，位第13体节前隔膜后侧，卵漏斗一对，位第13体节后隔膜前侧，后接短的输卵管。
两输卵管在第14体节腹侧腹神经索下会合，开口于此腹中线，称雌生殖孔。
另有纳精翼3对，位第7.8.9体节内。纳精囊由坛、坛管和一盲管构成。为储存精子之处。纳精囊孔开口子6/7.7/8.8/9体节之间腹面两侧。
在地球上蚯蚓分散很广，几乎遍及全国各处。据统计地球上大约27000多种，而本国大约160多种。
例如粪蚓、菜蚓、水蚓、秸秆蚓等品种。粪蚓包括爱胜属蚯蚓（日本大平二号、北星二号）、白茎环毛蚓等，菜蚓主要有威廉环毛蚓，水蚓主要有湖北参环毛蚓，秸秆蚓主要由进农六号。
其中适宜人工饲养且有一定应用价值的蚯蚓却很少。
例如爱胜蚓属、白茎环毛蚓、参环毛蚓、湖北环毛蚓等，其中以爱胜蚓属中的大平二号蚯蚓最为常见、饲养最多。