第一阶段小组赛结束之后，陈寰马上便准备组织第二阶段小组赛的比赛，为了有足够的时间准备决赛，陈寰希望在这一周之内就能够解决决赛之前的比赛，然后准备下下周日的校际交流赛，还有就是月底的决赛，他希望新生杯的决赛能够是这次团体赛的最*，同时为下个月社团节打响第一炮。
根据之前的赛程，第二阶段小组赛将分为三个小组进行，比赛的规则和第一阶段小组赛没有什么不同，每组依然是四支队伍，同样是前两名出线，不过另外还有两阶段成绩累加最好的两个第三名出线，共计八支队伍，抽签还是同一班级的两支队伍不相遇（不过只有卧龙2班和飞马4班的两支队伍都进入了第二阶段），当然之前同组的两支队伍也不相遇。
为了抓紧时间，抽签就是从刚刚结束比赛的飞马9班开始，不过这次抽签只抽1-12的数字（当然还是用扑克牌，11和12分别用J和Q代替），小组第一抽奇数号，小组第二抽偶数号，然后1-4为G组，5-8为H组，9-12为I组，如果同班的抽到同组就和后一个奇偶性相同的号码调换一下。
当然虽然说要尽快，但是陈寰也还是注意照顾了失败队伍的心情，没有在飞马7班的寝室里直接开始抽签，而是让林上霄把自己带到他的寝室里开始抽签的，而钱运这个时候则要负责安慰刘静廷，也就没有跟着陈寰（当然陈寰心里也不想他跟着）。林上霄抽出了一个1号签，刚刚出线的林胖子心情不错，于是就跟着陈寰一起看看自己这组会有哪些队伍，因为出线的队伍中飞马书院的队伍多达5支（飞马2班，飞马4班一队，飞马4班二队，飞马8班一队，飞马9班），再加上他们同组出线的又不是飞马书院的队伍，所以他只要走完飞马书院也就基本知道了。
不过他很快就知道了第一支和他们同组的队伍，因为飞马8班一队胡龙华抽出的是3号签，虽然说林上霄上一次在章许晴他们寝室战胜了胡龙华，但是那一次颇有些趁人之危的味道，这一回他还是希望躲开胡龙华的，知道了这一个结果之后林上霄就非常郁闷，毕竟飞马8班一队的目标看上去不低，虽然自己班级也是小组第一，但是如果不是因为自己这个小组太弱，再加上自己又偷了黎渡一盘，甚至自己班级在别的组连出线都成问题，心情不爽的他索性也不像之前想的那样去看下面的抽签了。
接下来抽签的是飞马4班的两支队伍，章许晴代表一队抽到了2号签，G组的队伍这个时候就已经出来三支了，关英瑞代表飞马4班二队抽到了8号签，不过他们还不知道他们这一组会有些什么队伍。
飞马2班一队抽到了7号签，看来I组将没有飞马书院的队伍，而陈寰接下来去了卧龙书院，因为卧龙2班的两支队伍都是小组第一，所以要先定下来，楚魁汉代表一队抽到了9号签，那么二队则只能安排在5号签上，而伏虎5班则将自动落位到11号签，接下来刘笑把卧龙3班抽到了6号位，但是由于上一轮和他们同组的卧龙2班二队也在这个组里，就自动挪到了最接近的4号位上。
可是这样一来，剩下的伏虎9班和奔牛1班不管怎么安排都不能满足不和之前小组赛的对手同组，所以陈寰只好再次改变了卧龙3班的签位，改到了12号位，这样之后的几个班级都有了基本自动的签位，最后分组如下：G组飞马9班，飞马4班一队，飞马8班一队，奔牛1班H组卧龙2班二队，伏虎9班，飞马2班一队，飞马4班二队I组卧龙2班一队，奔牛3班一队，伏虎5班，卧龙3班虽然说最后的几个队伍的抽签几乎已经没有别的签位可选，但是为了做好告知义务，陈寰还是尽量把每个队伍负责人的寝室都走了一遍，把具体的分组情况告诉了大家，不过之前已经走过的队伍寝室陈寰也就没有再去，而是先通过短信告诉了大家分组，准备一会儿发赛程的时候再去。
不过抽完签只是第一步，下面安排赛程的工作也不是一件简单的事情，陈寰在抽完签之后，就到了楚魁汉他们寝室开始安排赛程。他是不喜欢安排背靠背的比赛，所以要在一周里安排完比赛还是有难度的，再加上这段时间象棋社的裁判也很紧张，所以他不希望还像之前第一阶段那样同一时段安排场次太多的比赛，因此决定同一时段就安排两场的比赛。可是这样一来似乎一周又无法解决问题，因此他就想到了把部分比赛安排在寝室里进行，而且错开中午在体育教学部的比赛时间，这样的话他就可以多记录一些比赛。
经过一番思考，再征询了几个队伍的意见，终于决定了把哪些比赛安排在寝室进行，当然比赛的赛程非常紧凑，明天中午就首先进行I组的比赛，然后晚上则进行G组的两场比赛，然后第二天中午进行H组的两场比赛，这是一轮。然后周二晚上到周三晚上是第二轮，周四中午到周五中午是第三轮，这样可以在周末之前全部比完，然后周日进行两轮淘汰赛。
不过这样的安排似乎时间显得过于紧迫了一点，所以为了保险起见，陈寰把晚上的比赛的密度稍稍降低了一些，把H组的最后一轮比赛挪到了星期天早上，不过这一忙活已经是晚上八点多了，然后陈寰再去打印第二阶段的赛程表，再分发，一直忙到接近十点钟才解决了这些问题。
不过虽然这一天忙得相当辛苦，但是陈寰并没有觉得累，至少新生杯的第一阶段总体还算是成功的，他希望第二阶段能够变得更好。
不过事情真的能够这样吗？