飞云回到木叶已经有十几天的时间了，而他的内伤早已在回到木叶的第二天便痊愈了。这让木叶医院的医生们大为惊异。因为在根据他们的诊断，结合过往病例的恢复时间，他们推断，飞云至少要在一个月后才可以完全康复。这件事儿也惊动了三代，三代虽然也感到很是惊讶，但毕竟是大人物不是，比这还要不可思议的事情见得多了，所以也没觉得有什么不对的。因此，飞云在住院的第二天早晨便出院了，而他也只是在木叶医院里睡了一晚而已。至于内伤的原因，这就说来话长了。总之，他是在君麻吕出去找寻食物不在他身旁时，碰到了一个气息极为诡异的强大男人，奇怪的是那男人将他击成重伤后没有取了他的性命便自行离开了…
而和飞云一起回来的君麻吕，也已经被三代安排好了住处。不知为何，三代对飞云似乎有着一种莫名的信任。就拿飞云将君麻吕领回木叶的这件事情来说吧。虽然长老团们在这件事情上不停的在给三代施压，但是三代在这件事情上却是没有像往常一般做出让步，甚至没有给长老团留下一丝的商量余地。
自从回到木叶后，飞云便没有再跟随第七班一起做任务了。原因不是因为厌倦了，也不是因为不想，而是因为他还有很重要的事情要做。自从被大蛇丸击败后，他已经深刻的意识到了自身的不足，所以他这十几天，他在夜以继日的疯狂的苦修，就连君麻吕的事情也顾之不得了。这期间春野樱他们来看过飞云几次，无非就是让飞云快些回到队伍中来。而君麻吕也来找过他，从他的语气中，不难听出他对现在在木叶的生活很是满意。而不知为何，在飞云不跟随第七班一起做任务这件事情上，卡卡西竟然没有丝毫的难为飞云，而三代也没有说些什么。似乎是觉得也许飞云的实力已经早已不适合在这个班待着，或者说是不适合屈尊于下忍的队伍了吧。只是现在没有一个合适的机会和缘由，不然兴许飞云早已被三代提拔为木叶上忍了吧。
这天，飞云正在修炼场兀自苦修。
“出来！”正在修炼中的飞云突然出声道。
“嘿嘿。小鬼，你的实力不错嘛。”一个脸上罩着个面具的男子一边说着，一边从一旁的树林中缓步走了出来。看打扮似乎是木叶暗部的人。木叶暗部，全称是“暗杀战术特殊部队。”对于飞云来说，这是一个有些神秘的部门。
“说！”飞云的语气很是生硬，丝毫不给来人一丝一毫的面子，现在他可是在争分夺秒的提升自己的实力啊。一秒钟都耽搁不得，所以不愿意多蹦出一个字，更别说多说一句废话了。
“嘿嘿，别这么不懂礼貌吗。”来人听出了飞云口气中的冷漠，有些尴尬的挠了挠头。
见飞云没有再理会他，有些无趣的咳嗽了两声，“好吧好吧，说正事儿。三代大人让你过去一趟。”
“嘭”的一声，一阵烟雾过后，飞云已经消失在了那名暗部的视野里。原地已经没有了飞云的身影，有的只是一个目光呆滞的暗部…
“三代。找我有事儿？”飞云门儿也没有敲，就像回到了自己的家中一般，大大咧咧的推门便走入了火影办公室。
而三代对于飞云这种似乎有些放肆、没有礼数的行为已经见怪不怪了。
“这次找你过来是想要和你商量一下调班的事情。”三代斗笠下的双眼看了看已经在沙发上坐好的飞云，嘬了口烟，吐出一口烟气，缓缓地开口道。
“嗯？你刚刚说什么？”飞云掏了掏耳朵，向三代询问道。
“你没有听错。我是要和你商量一下调班的事宜。”三代肯定的道。
“为什么？”飞云大声质问道，他再也无法抑制住内心的惊讶，他感觉在现在这个班里挺好的啊，为什么要将他调出去。
“别冲动，孩子。听我来给你解释。因为以我对你现在实力的了解，就已经达到了上忍的程度，你还待在这个班中的话，鸣人他们的实力将无法得到最大限度的提升。”三代耐心的给飞云解释道。
“这又是怎么说的呢？”飞云穷追不舍的质问着。
“因为战斗中，你总是在独自撑着场面，而鸣人他们能够出手的机会着实是太少了些，而只有经历了战斗的洗礼，一个人的实力才能够得到最大限度的提升。所以…”三代说到这里没有继续说下去，他知道以飞云的聪明程度，他会理解的。
“嗯…好吧。那对我的安排呢？我想要听一听。还有，君麻吕你打算怎么办呢？让他补上我的位置空缺吗？”飞云仔细想了想，觉得三代说的有道理，所以他只好忍痛割爱了。人非草木孰能无情，他真的是舍不得第七班的那些伙伴们，当然还有卡卡西。但是他却不得不选择暂时的离开他们。
“嘿嘿。你吗…我自然早已安排好了。”三代说到这里，卖了个关子，没有继续说下去。
“哦？我洗耳恭听。”三代听到飞云的配合，笑容刚刚浮现在了脸上，下一刻便彻底的冰封住了。“但是是不是一耳朵进一耳朵出可就由不得我了。”飞云接着说道。
“咳咳”，三代好一会儿才缓回来，尴尬的咳嗽了几声，正儿八经的道：“说正题。我刚刚不是和你说了，要和你商量调班的事儿吗？既然是调班，必须要有新的班级了。”三代知道飞云虽然嘴上那么说，但是现在却一定是正在听着他的分配，于是接着说道：“你将和君麻吕还有井上昊頔一起组成新的十三班。”
“嗯？”飞云愣了一下，要和君麻吕一组啊。那也不错，起码不用担心没有人会照顾君麻吕这个问题了。“好的。我同意。”
“嗯。你同意就好。”三代有些好笑的看着飞云道，心中却是想着：你即使不同意也没有用啊。决定已经下来了。还有，我可是三代啊…这点儿面子你总要给我的吧…
“对了。”飞云似乎突然想到了什么，忽然出声道：“我的实力不会影响到那个叫做井上昊頔家伙的实力提升了吗？还有，那个井上昊頔究竟是哪一个？”君麻吕飞云还是了解的，他强大的实力飞云也清楚。这个昊頔是谁，他确实不知道了。甚至连听都没有听说过。