紧接着，7月2日，韩国外援金英权正式加盟；7月7日，国脚黄博文正式加盟。华南虎继续补强。
9月20日，亚冠1/4决赛首回合展开争夺，华南虎奔赴沙特，客场挑战伊蒂哈德。在这场比赛中，由于后防线上的接连失误，华南虎以2-4的比分不敌对手。但怀揣两个客场进球，华南虎回到主场仍有翻盘的希望。
10月2日，与伊蒂哈德的次回合交锋在天河上演。华南虎在比赛中一度2-0领先，晋级四强近在眼前。但可惜的是，终场前对方又打入一球，华南虎虽然在主场2-1赢球，但仍以总比分4-5不敌对手，亚冠遗憾出局。
亚冠出局之后的华南虎，也将精力放回了国内赛场。先是在10月7日，主场3-2力克山东鲁能，重回联赛积分榜首。紧接着，10月20日，客场1-1战平争冠对手江苏舜天。再接着，10月27日，依靠郜林的世界波绝杀，华南虎在主场1-0战胜辽宁宏运，提前一轮获得中超联赛冠军，也成为了首支卫冕中超的球队。
不止如此，11月18日，依靠巴里奥斯、孔卡和张琳芃的进球，华南虎主场4-2战胜贵州人和，总比分5-3获得了足协杯冠军。华南虎成为了2012赛季的中超足协杯双冠王！
虽然亚冠止步八强，但国内双冠王的成绩也足以令人满意，华南虎的2012赛季就此画下了还算圆满的句号。
经历了上一年亚冠的遗憾折戟，2013赛季一开始，华南虎就表现出了对进一步提升战绩的强烈渴望。先是宣布与巴西前锋埃尔克森正式签约，紧接着又接连签下了包括国门曾诚在内的一干强援。天河体育场的草皮改造工作也已完成，彻底解决了积水排水问题，提升了主场的质量。
2月26日，新赛季的亚冠联赛F组小组赛在天河体育场打响，华南虎在主场迎战劲敌日本豪门浦和红钻。最终，华南虎在主场以3-0完胜浦和红钻，再次赢得开门红！
3月8日，中超联赛开幕，华南虎在主场迎战上海申鑫，此役埃尔克森两射一传，孔卡、郜林、穆里奇纷纷破门，华南虎5-1大胜对手，中超亦迎来开门红。
3月16日，华南虎主场3-0完胜江苏舜天，报了此前超级杯输给对手的一箭之仇。埃尔克森在比赛中大演帽子戏法，获得了球迷们的顶礼膜拜，受封“埃神”称号。
接着，在亚冠赛场，华南虎也是一路高唱凯歌，主客场面对泰国蒙通联，分别以4-0、4-1的比分横扫对手，将对方的主场变成了“泰囧”的片场。
亚冠小组赛最后两场，华南虎虽然未能取胜，但因为之前打下的基础太过牢固，依然以头名毫无悬念地从小组出线。
5月15日，亚冠1/8决赛首回合客场面对澳洲的中央海岸水手，华南虎在先丢一球的不利情况下，凭借巴里奥斯和穆里奇在上下半时的进球，最终2-1逆转取胜，占得了先机。
5月22日，和“水手”的次回合交锋，华南虎在主场3-0完胜对手，以两回合5-1的大比分昂首晋级亚冠八强。
而另一边，在中超赛场，华南虎亦是所向披靡：6-1长春亚泰、2-0广州富力、3-0天津泰达、3-0上海申花、4-1辽宁宏运、1-0杭州绿城、4-0贵州茅台、3-1青岛中能、1-0上海东亚、4-1武汉卓尔、3-0上海申鑫、2-1江苏舜天、3-0北京国安、3-0大连阿尔滨……一路高奏凯歌的华南虎在中超赛场上创造了22场不败的骄人战绩！
在休赛期，郑龙火线加盟，水土不服的巴里奥斯离队，埃尔克森进入亚冠大名单，华南虎的阵容进一步得到了调整和加强。
8月21日，亚冠1/4决赛首回合，华南虎坐镇主场迎战卡塔尔莱赫维亚队。全场比赛结束，华南虎依靠孔卡和埃尔克森在5分钟之内的连续两球以2-0战胜莱赫维亚。
9月19日的次回合，华南虎更是在客场4-1大胜莱赫维亚，以总比分6-1横扫对手，挺进亚冠四强，为中国的球迷们献上了中秋大礼。
9月25日，亚冠半决赛首回合，华南虎客场挑战日本柏太阳神。最终华南虎在先失一球的情况下连进四球，以4-1大胜逆转。
10月2日，亚冠半决赛次回合，华南虎在主场迎接对手。尽管首回合的比分让晋级悬念变得已不那么大，但天河体育场依然被热情的球迷们所坐满。而华南虎依旧没有让球迷们失望，埃尔克森、穆里奇和孔卡组成的三叉戟大杀四方，再次打出了4-0的大比分。华南虎以总比分8-1狂胜对手晋级，再次为国庆佳节献上了一份大礼。
10月6日，中超联赛第27轮的一场天王山对决里，华南虎客场4-2击败山东鲁能，提前四轮卫冕2013赛季的中超冠军，成为第一只实现中超联赛三连冠的球队。
10月26日，亚冠决赛首回合，华南虎在客场对阵韩国首尔FC。埃尔克森和郜林在比赛中各下一城，最终双方战成2-2平。
11月9日，整个2013赛季中华南虎最重要的一战到来了：亚冠联赛决赛次回合，华南虎坐镇天河主场迎战首尔FC。全国上下无数球迷和媒体都将目光注视到了这场比赛身上，可谓万众瞩目。第57分钟，华南虎率先由埃尔克森反击破门。4分钟后，首尔队德扬扳平了比分。最终双方踢成了1-1平，总比分战成3-3，华南虎依靠客场进球的优势夺得了亚冠联赛冠军！这是自从亚冠联赛改制以来，中国球队首次登顶亚洲之巅。此外，华南虎还创造了一系列亚洲足球的新纪录，如亚冠史上进球最多、亚冠史上最多净胜球、亚冠史上场均进球数最多、亚冠史上最强主场、亚冠史上最年轻的夺冠球队等等。
成为了新一届亚洲冠军的广州华南虎也代表亚洲去参加了在摩洛哥举行的世俱杯。1/4决赛中，华南虎2-0战胜了来自埃及的非洲冠军阿尔阿赫利，挺进世俱杯半决赛。
12月18日，世俱杯半决赛在摩洛哥阿加迪尔体育场先赛一场，亚冠冠军广州华南虎迎战欧冠冠军拜仁慕尼黑。虽然最后华南虎0-3不敌拜仁，但能在世俱杯这个平台和世界最顶级的球队进行正面的交锋，华南虎也算是收获颇丰。
12月22日，世俱杯季军战展开争夺，广州华南虎对阵小罗领衔的南美解放者杯冠军米内罗竞技。最终，华南虎以2-3憾负对手，获得了世俱杯第四名。
拿到了中超、亚冠双冠王，并去到了世俱杯和来自欧洲、南美的顶级强队进行切磋，2013赛季注定是广州华南虎队史中全面丰收、最为不平凡的一个赛季。
携亚冠冠军之威，广州华南虎在2013年底举行的亚足联年度颁奖典礼上包揽了亚洲足球先生、亚洲最佳外援、亚洲年度最佳俱乐部在内的多项大奖。而广州华南虎足球俱乐部的世界排名也一度上升到了第35位，稳居亚洲第一。同时也是唯一跻身亚洲前40名的中超俱乐部，将很多国际足坛知名的俱乐部甩在了身后，包括意大利老牌劲旅国际米兰、拉齐奥等。
但欣喜之余也有不舍。球队中场核心孔卡在赛季末宣布结束两年半的合同，回归母队弗鲁米嫩塞。一代“天体之王”的广州生涯就此划上了句号。尽管球迷们百般不舍，但还是选择了尊重孔卡本人的选择。
有人去就有人来，2013年12月14日，华南虎官方宣布巴西豪门桑托斯队的中场球员雷内加盟球队。紧接着，华南虎又以自由转会的方式签下了梅方和刘健，进一步提升了球队的阵容厚度。
但孔卡离去之后，华南虎阵中仍然缺少一个核心人物。关于孔卡的接任者的消息从年底开始不断传出。终于在2014年2月7日，华南虎俱乐部为球迷们带来了一份新春贺礼：官方宣布以690万欧元的转会费签下了意甲传统劲旅博洛尼亚队长、意大利现役国脚迪亚曼蒂。这一消息传出，广州球迷们欢呼雀跃，广州队又迎来了一位大牌球星！
2月26日，新赛季的亚冠小组赛首轮，卫冕冠军广州华南虎在主场迎战澳大利亚的墨尔本胜利队。迪亚曼蒂上演首秀，在上半场0-2落后的情况下，梅开二度帮助华南虎以4-2上演惊天大逆转！赛后，迪亚曼蒂也受到了球迷们的热情追捧，获封“天体之帝”。
2月28日，再次传来好消息：广州华南虎足球俱乐部官方宣布与里皮教练团队正式续约三年，续约期从2014年12月1日至2017年11月30日。里皮团队的这一续约行为再次给了广州球迷莫大的信心：这证明了里皮教练团队将会长期扎根广州，华南虎的未来依旧值得期待。
3月8日，新赛季中超联赛首轮，卫冕冠军广州华南虎主场迎战联赛升班马河南建业。华南虎再次延续了他们“开门红”的传统，以3-0击败了对手，取得良好开局。
3月12日，亚冠小组赛华南虎客场挑战日本横滨水手，迪亚曼蒂再次上演任意球世界波，帮助华南虎1-1逼平对手。紧接着，3月18日，华南虎在主场3-1战胜了老对手全北现代，小将廖力生在此役大放异彩，一传一射帮助球队获胜。