李贤是武则天在前往昭陵的路上生的，差点让武则天难产而死，故而武则天非常不喜欢李贤、甚至造谣说李贤不是自己亲生的，而李贤也知道自己不招母亲的喜欢、暗中积蓄力量与母亲进行对抗。
掌握了军权的武则天，开始推行自己的改革，即所谓的“建言十二事”：
一是“劝农桑、薄赋徭”，大力发展农业生产、减轻百姓的税负；
二是“给复三辅地”，重点减轻长安及周边地区的税负；
三是“息兵、以道德化天下”，终止了对吐蕃大规模进攻的准备，转而以防御为主；
四是“南、北中尚禁浮巧”，让朝廷直营的手工工场停止大规模制造奢侈品；
五是“省功费力役”，减少征发民夫进行工程建设，与民休息；
六是“广言路”，鼓励文武百官积极上书、评议国政；
七是“杜谗口”，打击诬告、诽谤的风气；
八是“王公以降皆习《老子》”，要求文武百官学习李唐国教道教的经典；
九是“父在为母服齐衰三年”，要求人们为母亲服丧也要服满三年；
十是“上元前勋官已给告身者、无追核”，上元元年之前的荫举勋官，不按新的任官标准罢免；
十一是“京官八品以上、益禀入”，增加在京文武百官的薪俸；
十二是“百官任事久、材高位下者，得进阶申滞”，任职时间长、有才干的人，可以申请升官。
在推行改革的同时，为了获取李治的信任，武则天派人杀死了被自己流放的异母兄长武元庆和武元庆——两人在武则天年少时折辱过她和她的母亲，被当上皇后的武则天找借口流放了，还被赐姓为“蝮”。
虽然李治信任武则天，但是武则天与儿子李贤之间的矛盾却越来越深，特别是李治和武则天的宠臣明崇俨突然遇刺身亡——他曾向武则天劝说改立武则天最宠爱的李显继位；
最终，武则天发动了李贤谋反大案，派宰相裴炎去调查李贤、从李贤府上搜查出轻甲数百件，得知妻子武则天与儿子李贤之间的矛盾不可调和后，李治选择委屈儿子李贤、改立李显为太子......
（裴炎由在《新三国》中扮演曹操的陈建武出演）
在《女皇》第一季《武曌传》的大结局，即将被流放的李贤，苦笑着向母亲武则天交出了父亲李治赐予他保管的传国玉玺，并且向武则天进献了一盒宝物：
说是自己马上就要被流放、来不及参加妹妹太平公主李令月的婚礼，希望武则天能帮他转交；武则天答应了李贤的请求，接着来到朝堂上，宣布废李贤、改立李显，以及太平公主李令月即将举办大婚......
江南和左宁南等海蓝文学以及飞奈华夏制作中心的编剧们，一起完成《女皇》的第一季大改后，就又被拉去参与电视剧《长安城十二时辰》的宣发了。
相比投资1.58亿的《拍案惊奇：袁天章》，投资5.62亿的《长安城十二时辰》的宣发力度要高出一个数量级——飞奈华夏平台在宣发《长安城十二时辰》上可谓是火力全开！
由于飞奈华夏平台是一次性放出全部剧集，所以宣发模式和电影是一样：除了在各大流媒体平台、互联网社区进行宣传，还找各大院线购买了广告时间，用于播放《长安城十二时辰》的宣传片；
也正是因为飞奈华夏平台是一次性放出全部剧集，只比《长安城十二时辰》早上线3周的《拍案惊奇：袁天章》、和比《长安城十二时辰》晚开画1周的电影《阿修罗王》，才不会和《长安城十二时辰》发生太大的冲突。
和《拍案惊奇：袁天章》一样，《长安城十二时辰》也和女团选秀《长风破浪的姐姐》进行了联动：
不同的是，《拍案惊奇：袁天章》与《长风破浪的姐姐》的联动，只是在节目上播放了宣传片，请出演男一号的张振穿着飞鱼服、腰佩绣春刀，来节目展示了拳法和剑(刀)舞——张振拿过神矛杯八极拳武术比赛的青年组一等奖，还是有两把刷子的；
而《长安城十二时辰》与《长风破浪的姐姐》的联动，则是中生代女艺人们来到电视剧拍摄的影视城，换上了盛唐服饰、在影视城玩了小半集，然后欣赏并学习霓虹羽衣团的盛唐歌舞表演，最后分组表演不同的盛唐歌舞。
《长风破浪的姐姐》每周一集，与《长安城十二时辰》的联动是在其上线前的那一周放出来的，也就是第4期，从这一期就要开始公演和首轮淘汰了——跑去当成团见证人的徐静还特意引用了朱元璋的名言“金杯共汝饮，白刃不相饶！”
由于是公演和首轮淘汰，第4期吸引了不少因第2、3期有些冗杂的观众，让收视率冲到了3.02%的新高，进而也给《长安城十二时辰》带来了很好的宣传效果。
除此之外，《对话古今》、《一起读书》等华夏台科教频道的电视节目也进行了联动，南山影视的网页版和APP也给了首页推荐......《拍案惊奇：袁天章》用过的盗版战术，《长安城十二时辰》也用上了！
为了尽可能吸引不是很爱看电视剧的男性观众，《长安城十二时辰》还和游戏《刺客的信条》系列的制作公司土豆娱乐进行了合作，联合制作了一款CG版的《长安城十二时辰》宣传片，用了《刺客的信条》的飞鹰、袖箭、宗教符号等元素。
事实上土豆娱乐和飞奈商量过：如果《长安城十二时辰》的成绩足够好，他们真的会考虑以盛唐长安为背景、制作一部《刺客的信条：长安》！
由于近些年烂剧太多、而且大部分电视剧都是女性向的，相当多的男性消费者已经不看电视剧了，而飞奈华夏平台与土豆娱乐合作的CG宣传片，无疑吸引到了大量不怎么看电视剧的男性受众。
飞奈华夏平台还通过南山影视电视节目制作中心的王副总裁，与南山游戏的美天工作室进行了合作，让国民级手游《荣耀王者》出了一个刺客新英雄“张小敬”！