三年后，新人类联邦首都"共生城"。
叶辰站在基因调控中心的天台，俯瞰着这座由生物材料构成的城市。建筑表面流动着荧光脉络，悬浮列车沿着DNA双螺旋轨道穿梭，空气中弥漫着雨后青草的气息——这是基因优化后的生态系统在呼吸。
"父亲，该出发了。"叶小雨抱着平板电脑走来，她的左眼闪烁着银河般的数据流，"今天是全球基因融合协议签署三周年纪念日。"
叶辰注意到女儿脖颈处新增了一圈淡金色鳞片，这是她突破第四基因锁的标志。他伸手抚摸女儿的头发，触碰到的却是水晶般的质感——这是新人类进化出的信息素传导器官。
"小雨，你真的决定了？"叶辰看着女儿的眼睛，"一旦公开你的研究，可能会引发新的伦理争议。"
"但这是阻止基因固化的唯一办法。"小雨调出全息投影，展示着新人类群体中出现的基因退化现象，"过度依赖基因优化，反而让我们失去了自然进化的能力。"
这时，逆鳞系统突然发出警报。叶辰的左眼投影出城市各个角落的异常波动——基因共鸣装置正在不受控地启动，无数新人类陷入痛苦抽搐。
"九黎会的残留代码！"小雨迅速操作平板，"他们在利用庆典直播传播基因病毒！"
叶辰抱着女儿跃向基因调控中心核心区，途中看到林夏正在空中与变异的安保人员战斗。她的战术服已经进化成半透明的生物铠甲，每道伤口都会迅速自愈。
"去主控室！"林夏甩出基因链束缚敌人，"我闻到了血手的味道！"
叶辰在实验室里发现了陈墨，她的腹部正在生长出第二颗心脏，九黎会的图腾在皮肤下若隐若现。这位财经记者如今已是基因伦理委员会主席，此刻却被基因病毒操控着启动自毁程序。
"墨姐，醒醒！"叶辰按住她的肩膀，逆鳞系统开始净化病毒。陈墨突然暴起，指甲变成骨刃刺向叶辰喉咙，却在最后一刻转向自己心脏。
"快阻止我！"陈墨眼中流出蓝色泪水，"他们要毁掉整个共生城！"
叶辰果断将她推进基因重置舱，舱内的液态金属瞬间包裹全身。与此同时，实验室穹顶被炸开，血手的金属残躯悬浮在云端，九条基因链正在吸收庆典现场的进化能量。
"叶辰，你以为建立联邦就能终结九黎会？"血手的声音通过所有电子设备传播，"真正的进化，是让强者吞噬弱者！"
叶辰看到城市上空浮现出无数基因链构成的漩涡，所有新人类都被吸向漩涡中心。他将小雨推进安全舱，自己冲向调控中心的能量核心——那里存放着当年血手的心脏。
"逆鳞系统，启动终极融合！"叶辰将心脏嵌入自己胸腔，蓝金双色光脉瞬间覆盖全身。他的意识与血手残念在基因层面展开对决，看到了九黎会创始人的记忆：
在核战废墟中，一位科学家将人类基因与龙血融合，试图创造能适应辐射的新物种。他的女儿在实验事故中丧生，促使他走向极端，认为只有强者才有生存权。
"这就是你追求的进化？"叶辰在意识空间质问，"用暴力创造的未来，永远不会有和平！"
血手的残念突然分裂成无数光点，叶辰看到其中一颗光点里藏着林秋的基因片段。他伸手触碰，林秋的意识在光华中显现："阿辰，还记得我们第一次约会吗？"
现实世界中，叶辰的眼泪滴在血手心脏上，九条基因链突然转变为DNA双螺旋结构。所有被吸入漩涡的新人类都被光茧包裹，基因病毒在茧内被净化。
当叶辰再次睁开眼时，发现自己躺在共生城的中央公园。林秋正抱着恢复人类形态的陈墨，老刀站在一棵发光的银杏树下，戒刀上的梵文与树叶的脉络形成共振。
"爸爸好厉害！"小雨跑过来，她的鳞片已经完全褪去，"我刚刚用意识网络读取了所有人的记忆，发现九黎会的基因病毒其实是共生程序！"
叶辰惊讶地看向女儿，逆鳞系统突然接收到来自未来的数据流——那是某个平行时空的自己发来的警告："小心基因委员会里的背叛者！"
就在这时，基因调控中心的警报再次响起。叶辰通过逆鳞系统扫描，发现周正龙的变异体正在太平洋底建造基因武器，而林夏的生物铠甲中检测出九黎会残留代码。
"看来和平只是暂时的。"叶辰抱起女儿走向议会大厦，"我们得准备迎接真正的基因黎明了。"
远处，血手的心脏悬浮在城市上空，表面浮现出新的纹路。叶辰知道，这既是结束，也是新的开始。