大蛇丸因为木叶崩溃计划前往木叶。
晓组织因为圣杯前往木叶。
黑绝追寻着母亲，也就是暂时褫夺了辉夜姬身份的千秋净月来到木叶，并根据心目中的母亲，也就是千秋净月的吩咐在各国之间煽风点火。
六道骸存在于火之国，伪造出了让火之国众人都毫无异议的姬君身份。
圣杯战争吸引了忍者视线的同时，五大国之间的摩擦也越发激烈起来。
六道骸所扮演的姬君也在本次圣杯战争中揭露了千秋净月的“身份”，为火之国大名的继承人，因为不明原因离开消失匿迹。
而圣杯战争之中，漩涡鸣人最终取得了胜利，波风水门同漩涡玖辛奈复活。
春野樱同我妻由乃告别，想要归还我妻由乃的书籍，却被由乃告知她成为了神明候选人之一，这本书本身就是她的能力。
我爱罗成为小圣杯，体内来自圣杯的一部分黑泥和守鹤打的不可开交，小红作为尾兽之一加入了守鹤一方。
最终守鹤同圣杯之中的一部分黑泥两败俱伤，我爱罗暂时获得主动权，作为违规者强行窃取圣杯的一部分力量，留下了母亲。
等到圣杯战争结束，打响第一炮战争的是土之国和火之国，砂忍村作为土之国的防御力量，在战争中倒向了火之国。
而另外的三大国家同时发难，要求诛灭砂忍村的不义之举。
火之国手握木叶村和砂忍村的两大力量，自然不应允，强势拒绝。
另外三大国家因为火之国强势的态度感觉锋芒在背的同时，又不甘心于曾经平起平坐的火之国驾临于他们头顶，四国战争一触即发。
月之眼的计划随着战争在悄然实行，我爱罗体内的黑泥因为我爱罗长期处于战场之中，而逐渐开始影响到我爱罗。
正值第七班抵达砂忍村合作之际，春野樱日常翻阅她本人的《珍视之书》，却愕然的发现了十分钟的团灭结局。
书的提前预警让春野樱和小火逃出生天，却没有拯救的了鸣人和佐助，带着悲伤春野樱前往火之国王庭，寻求圣杯的帮助。
同样在这场失控之难中存活的还有负责送我爱罗礼物的蝎，傀儡的损失让蝎受了重伤，但依旧比起春野樱更快抵达火之国王庭。
春野樱到来的时候，蝎认为砂忍村本身就是土之国势力，并不可信，而春野樱坚持我爱罗是因为黑泥的力量失控，若不是我爱罗在最后关头恢复一丝理智所有人都无法逃离。
双方争执不下，却遇见了笑眯眯前来的太宰治，对方邀请吧春野樱同蝎一起前往大名面前，合理讲出本身的意见。
在火之国大名的身边，春野樱遇见了久违的千秋净月，在蝎的坚持中，千秋净月和大名交换了意见，最后决定让缘一以及星忍村的星忍陪同出发，探究这次事件。
战争吧如火如茶，我爱罗的失控是战争中的一个局部，春野樱请求千秋净月帮助的时候，被如此回绝，但却得到了千秋净月承诺会让神威暗地中协同。
一行人前往抢救我爱罗的过程中，鸣人委托给春野樱的遗物小火却被夺走，事情进展到关键时刻，春野樱无法放弃鸣人的遗物，毅然离开打算从神秘人手中救回小火。
黑绝在执行母亲的一统天下的计划，却发现了宇智波带土隐隐有着失控的征兆，没等黑绝反应过来，宇智波带土已经反刺了黑绝。
等黑绝回过神来，却暴跳如雷的发现宇智波带土的月之眼计划就差临门一脚——我爱罗体内的守鹤。
黑绝决定将计就计，暗中引导宇智波带土成功捕捉我爱罗，可在分离我爱罗身体中尾兽的过程中，宇智波带土却陷入了困境。
我爱罗体内的守鹤同黑泥纠缠太深，一但要取出来就势必要让两者一同取出，见识过圣杯中黑泥影响力的宇智波带土并不想这样冒险，于是想到了另外一个人——漩涡鸣人！
对方曾将九尾力量留在体内，单独的塑造了九尾身躯，将九尾隔离到体外。
通过大蛇丸，宇智波带土做好了一切准备，而黑绝也在暗中搞事情，其中春野樱一路追杀过来，也带来几分变数。
最后黑绝的暗手成功，宇智波带土剥离尾兽守鹤失败，反而意外的剥离了我爱罗体内的黑泥，不等宇智波带土补救，春野樱已经带着小火和剩余恢复的尾兽杀了进来。
大蛇丸习惯性的跳反，将秽土转生鸣人的操作权限麻溜的转让给了杀过来的水门夫妇，而月之眼造成的意外和我爱罗的小圣杯体质导致了一场违规的圣杯战争再次开启。