车臣汗兵败被杀，而至于作为联军的另外一个高级指挥官，卓特巴巴图尔携幼弟达哩及残部逃奔西海。
只是西海也并不太平，是时诸夏有滇、黔之变。秦、蜀间峰烟起，噶尔丹扫平了车臣之后，便觉得自己应该谋所地。
乱世之英雄，就是需要一个足够聪明的头脑，看见别人所不能见得先机。只不过，噶尔丹的一腔热血，五世达赖不赞成。
所以派出喇嘛使高僧语之噶尔丹曰，‘非时！非时！不可为’。
噶尔丹这个时候还需要五世达赖的支持，所以对于这样的劝诫只能答应放弃。虽然是明面上答应了达赖，不会作出什么事情。
但是噶尔丹仍旧还是与其谋臣曰，
‘立国有根本，攻取有先后，不可紊也。李克用之先世，发迹金山，根本不立，遂不能成大事，我太祖初兴，灭国四十，奄有四万，然后促夏执金，混为一尊’。
这一番话，噶尔丹深以为然也以为却是是这样的。而几个亲随也相信这些话。不过噶尔丹的现实，却不允许噶尔丹出兵。
就算是这些计谋，乃为‘近攻计’。这“近攻计”的具体步骤是先统一天山北路之卫拉特蒙古诸部，进而出兵天山南路，统治回疆，以确立准噶尔在天山南北广大地区的有效统治。
然而噶尔丹这一场率兵打败车臣的战争，令噶尔丹的叔父觉得，噶尔丹就是一个威胁。
噶尔丹如今已经有了军功，只怕是更加的在意汗位。所以，噶尔丹的叔父觉得自己不能放任噶尔丹成长。
“按理说，噶尔丹你作为僧格的胞弟是有资格继承汗位的。只是如今，你刚回到部族不久，很多情况还是不熟悉的。”
一脸的我是为了你好，所以你应该感恩戴德的表情，噶尔丹没有想到自己的叔父居然是倚老卖老。
“叔父为了侄儿着想，侄儿自然是很高兴的。只不过，叔父侄儿虽然不了解如今的准噶尔。但是侄儿却还是一个族人，作为氏族的一员难道也没有机会。”
噶尔丹不吃这一套，所以对于叔父说所的话，没有半点同意的意思。
“再说了，本来作为哥哥的弟弟，我就应该接手汗位，不是么。”噶尔丹本来就是在出兵前，就已经想好了。借着战争的机会，给自己树立无上的威严。
结果，如今到好，自己的叔父不但是想要夺取自己的权利，还要将自己赶尽杀绝。“你不过就是战胜了一个车臣罢了，难道你以为在这里就有你的容身之处。”
眼见着噶尔丹是油盐不进，作为叔父的也失去耐性了。这眼看噶尔丹不愿意屈服，便觉得劝说不行那就武力好了。
“既然你认为叔父是害了你，那么你就好自为之吧。”说完之后，叔父就怒气冲冲的走了。
“将军，是不是要我等准备一番。”看着噶尔丹在叔父走后的沉思，也知道这叔侄两人如今是闹翻了。作为部下的，自然是要跟着自己的首长。
“罢了，这件事不必。但是，还是要在暗中提防着。”
噶尔丹有心想要在滇缅祸乱，以及蜀秦之变之中，想要获取渔人之利。只是奈何，偏偏就是这个时候自己还没有得到汗位。
噶尔丹以为自己需要更长的时间，来得到自己想要的。只不过，结果最后表明，不尽然。
康熙十二年，噶尔丹借口其从兄弟巴噶班第，与自己的兄长僧格有隙。所以噶尔丹觉得，自己兄长之死其实是与从兄有关系的。
所以噶尔丹发兵讨伐巴噶班第及其父楚琥尔乌巴什，这是噶尔丹想要在挫败了其他人之后，为自己掌权找到的完美借口。
但奈何出师不利，噶尔丹兵败受挫，兵败后的噶尔丹被追杀。这个时候，噶尔丹不得不求助于，以前支援自己的人。
比如，与吐蕃一样，支持自己的鄂齐尔图。噶尔丹求庇于鄂齐尔图车臣汗，本来鄂齐尔图当初，支援噶尔丹就是为了使准噶尔内乱。
只有这样，鄂齐尔图才能够得到自己想要的东西。
所以这一次，噶尔丹向鄂齐尔图求救后，作为自己的一个旗子。这个时候噶尔丹还不是死的时间。所以，鄂齐尔图汗答应庇护噶尔丹。
但是在鄂齐尔图汗的部族，因为噶尔丹是一个丧家之犬，所以噶尔丹总是会被嘲笑奚落。
噶尔丹最初还能够忍受，但是久而久之，面对这样的奚落刁难。噶尔丹到底还是天之骄子，忍受不了这些嘲讽。
不久，噶尔丹又与鄂齐尔图车臣汗反目为仇。既然是反目成仇了，自然噶尔丹不能呆在鄂齐尔图的地盘上。
至于两个人反目成仇的原因，无非就是因噶尔丹不能忍受屈辱。而这些屈辱似乎算是，鄂齐尔图汗授意为之。
所以噶尔丹一忍再忍之后，发现原来对于自己不友好的，居然就是鄂齐尔图之后，更受受不了。“呵，你居然是连这点刁难都受不了。”
“既然如此，有如何能够成大事。”鄂齐尔图汗并没有觉得自己错了。反而是对于这般的在意，有些不喜欢。觉得，噶尔丹就是想多了。
之后，噶尔丹与自己闹翻了，一走了之。虽然是有些觉得可惜，浪费了一个旗子。但是，鄂尔奇也没有在意。
反而是在承渊十四年，鄂齐尔图车臣汗与楚琥尔乌巴什联兵进攻准噶尔。噶尔丹在离开了鄂齐尔图后，就开始联络了吐蕃的一些贵族。
噶尔丹希望能够得到吐蕃道德支持，虽然是得到的钱财不多。但总算是聊胜于无，而噶尔丹在于吐蕃有来往的同时。
对于在西域的高昌国，噶尔丹也是加紧联系的。只要是对于自己友好的，噶尔丹都抱着试一试的心态，进行商议。
如此一来，噶尔丹的收获还是不少的。比如，对于噶尔丹而言，与北方的沙俄搭上关系就是一个更好的保证。噶尔丹知道，自己的优点在何处。
所以这一次的鄂齐尔图汗的联合进攻才会失败，况且这已经不再是只是失败。更是一次羞辱，一次噶尔丹对于厄齐尔的羞辱。
这一次失败后，鄂齐尔图汗受到了很大的损失。所以，不得已只能够退回到自己的地盘，修生养息。
而噶尔丹却没有给鄂齐尔图一个喘息得见机会，次年，噶尔丹主动出击，擒获楚琥尔乌巴什，杀其子巴噶班第。
迫使巴噶班第之子憨都逃往额济纳河，已经没有家园的憨都，过的凄惨无比。可以说与野兽同群也是不为过，而这一切都是噶尔丹的杰作。
除了将当初与鄂齐尔图结盟的人铲除，噶尔丹接着又于康熙十六年正月二十日，着手准备新帐旧恨与鄂齐尔图汗一起清算。
噶尔丹自斋尔的特莫火拉，向鄂齐尔图车车臣汗发起攻击。噶尔丹用来两年的时间来准备这一切，自从被攻击后，噶尔丹清醒的意识到。
除非自己能够将西域平定，否则在西域，尤其是在西宁定居的其它像是羌西等族，今后一定会是自己的威胁。
有了自己的目标之后，噶尔丹一心一意的准备要扩大自己的版图。将自己的从兄杀害，也将自己的叔父杀害之后。
得到准噶尔统治权力的噶尔丹，已经不再满足于准噶尔这样一个小小的地方。至少，整个西域也应该是自己统治的。
所以，这一次的战争，就是一个号角声。奏响了，噶尔丹征战路途的开端。
噶尔丹一举，将鄂齐尔图打乱。而鄂齐尔图车臣汗的部众，部分为噶尔丹所并，部分逃到西宁与湟水交界处。
而至于鄂齐尔图汗其妻多尔济拉布坦，则率少数随众逃往伏尔加河畔的土尔扈特汗国。噶尔丹实现了“胁诸卫拉特奉其令”的目标。
至此之后，盘旋在噶尔丹西部的隐患，这个时候是完全的除去了。
除掉了一个危险，对于噶尔丹来说却在背后，还盘庚着更多的威胁。十八年七月，噶尔丹领兵三万，想到一直在自己北边的吐鲁番。
噶尔丹定下目标，将侵吐鲁番。定下了目标之后，噶尔丹率领军队，渐次内移，往后西套，前哨已至哈密。
一个完美的翁中捉鳖，就这样形成。噶尔丹的计划，完全没有被吐鲁番察觉到。所以当知道噶尔丹率军围攻，想要抵抗的时候，已经是晚了。
噶尔丹用武力迫使吐鲁番、哈密臣服，这个时候，属于噶尔丹的势力已伸展至甘州一带。
噶尔丹的势力，绕过了驻扎了清军的玉门关与嘉峪关，从祁连山的南面入手。虽然是划地而治，但是噶尔丹也还是不敢放肆。
只得驻屯在甘州附近，向撒里维吾尔族地方的军队征收硫黄、倭铅等贡赋。而至于自己派遣军队，噶尔丹还是顾忌皇帝的。
同年，噶尔丹又以西域既定，诸国咸愿奉为汗为自己的意愿。噶尔丹乃请命达赖喇嘛，卜先克兔汗。
达赖喇嘛五世应噶尔丹之求，赠“博硕克图汗”号。本来吐蕃的人因为噶尔丹在吐蕃生活过，因此对于噶尔丹还算是比较亲近。
所以，五世达赖册封噶尔丹，就在情理之中。噶尔丹成为自也先称汗后，这是准噶尔部自建立以来，绰罗斯家族自称汗的唯一封建主。
在征服了西宁以及得到了吐蕃的支持之后，想着如今大清依旧还是陷入内战之中，不得出。噶尔丹制定的近攻计，开始实行自己的第二个战略步骤。
即是噶尔丹要征服天山南路的回疆地区，此时的南疆已经是属于噶尔丹。而统治天山南路的察合台后王势力已衰，维吾尔族自己也是有了内乱。
维吾尔族内，和卓势力日益强大。和卓势力中分成了白山派和黑山派，彼此利害冲突，严重对立。