而后，黄梧又积极招抚郑氏官兵，并做好投诚官兵的安抚工作。
同年三月，黄梧率兵攻打乌龙江罗星塔，打通南北的咽喉要塞。九月，同宁海将军固山额真郎赛一起收复失地闽安镇，复厦门。
顺治十五年（1658年），顺治帝据黄梧之功，再加追赏。其时，清军水师战具缺乏，黄梧遂捐造战船一百艘，加紧训练水师。
顺治十七年（1660年），黄梧晋升为太子太保，是时，与总督一起率水师出海门斩郑军闽安侯周端。
康熙元年，郑成功在台病逝。
康熙二年（1663年）初，郑经即位。
同年四月，黄梧向清政府上书密陈：“彼众贼心未定，又未纠合完备，当应趁其慌乱犹豫之际，神速进兵剿灭之”
同年六月十九日，兵部采纳了黄梧的建议，同时清廷亦批准了兵部意见。十月，黄梧与施琅出漳州破厦门、金门，第二年收复铜山，迫使郑军退守台湾。
至此，郑军来降将官二百八十多名，士兵达三万余众，福建全省尽归清廷所有。
康熙六年，康熙帝对黄梧作了一次简单的评价：“海澄公实心效力，屡著劳绩。”并赐金匾“勋高九锡”，授“一等海澄公”准袭十二次。
黄梧衣锦还乡后，回到霄岭省亲。黄氏族人敦请黄公台为家乡修建一座圆土楼，黄梧也刚好有此心意，因为为了防御郑经军队侵扰平和，真是不谋而合，于是便着手筹备，大兴土木。
黄梧要建大楼的消息一传开，远近的风水师傅、圆土楼的建筑工匠纷纷前来为黄梧效劳，提出各种建议。
黄梧看中其中一张图纸，道：“这张图所设计的大楼结构、布局甚合我意，但是土楼的形状还是以月眉形的为好，对准漳州这一方向为直线形，多设炮眼。大门上面还应该增设一个大水柜，楼里要有七口水井，万一敌人放火时，水源才能充足，这样以利防御外敌侵扰。”
之后，风水师傅们又纷纷出谋献策，择定黄道吉日，破土动工。
黄梧看后都不太满意。这时，又来了一位浓眉大眼的中年人，他择定的时日特别怪，被人们称为“怪仙”。
怪仙得知黄梧要兴土木，也就预先为他看个日子。
清早，怪仙不慌不忙地来到黄梧身边，神秘地说道：“昨晚，小人梦见一大好时日，如果按这个时日开工动土，日后子孙一定会大富大贵，就是贼寇要攻楼也没法攻破。楼内黎民百姓不管婚丧喜庆，都不必找人择日。”说完，就拿出日课给黄梧观看。
黄梧不看则已，一看就紧锁着眉头，你道为什么？
原来，这怪仙献出的是“天杀日”、“天杀时”，这在封建迷信十分盛行的时代，一般人是不敢运用的，更不敢在这天大动土木的。只过了片刻，却见黄梧舒展双眉，满面堆笑地说：“好，就选这个时日！”
因为，黄梧了解怪仙的用意。以黄梧如今的官威，岂能压不住煞神？
动工那天，只见黄梧身着公爷服，手执红珠笔，坐在工地中央，当煞时一到，黄梧手中的红珠笔如箭一样飞出去，破了煞，随即奠基动土，事后工程进展十分顺利。
由于黄梧建土楼的银两充足，且工匠众多，人手齐备，不久就要放中脊大梁了。正在这关键时刻，黄梧又回到工地来，风水师傅满意地笑了。因为，竣工这天也是选在“天杀日”、“天杀时”，这个时辰只有黄梧才能压得住煞神，破得了煞气！
土楼建成了，康熙皇帝便派康亲王前来祝贺。
康亲王赐一金匾，匾上题写着“霄岭藩垣”四字。
“藩垣”二字对于民居来说承受不起，朝廷用“藩垣”二字赐给黄梧所建楼房，说明清朝对黄梧的重用，所以黄梧看到康亲王送来这个金匾，非常高兴，就请来几棚好戏，在楼前连演十天十夜，热热闹闹庆祝一番。
就在黄梧回到霄岭，参加黄姓家族所建的霄岭藩垣楼落成典礼时，有一天早上，黄梧为了勘察地形，来到藩垣楼左上方的一个叫客寮尾的小山头上，他看见有一个破草寮，就问身边的堂叔道：“原来这里不是住着一户人家吗？”
堂叔就同黄梧谈起了有关这草寮的事。
原来，这户人家只有父女二人，父亲五十多岁，女儿年满十八，父女两人以做木屐为生。
有一天晚上，父亲杜老汉正埋头做着木料，这时有一只百多斤重的大老虎看到这里有亮光，就走过来，东张西望，然后就坐在门外，屁股朝着草寮，虎头向前观看着藩垣楼。
因草寮围墙是竹片围成的，有缝，无意中虎尾巴就卷入厝里。
杜老汉看见一条尾巴在动，以为是大山猫，但详细一看，是一条大尾巴，再仔细一瞧，着实把他吓了一跳，原来是一只大老虎的尾卷入屋中，怎么办呢？
身居草寮，搞不好父女俩性命难保。
杜老汉思来想去，他下决心豁出去了，砍下老虎尾巴，把老虎吓走。于是他硬着头皮，壮了壮胆，举起手中的斧头，用力狠狠地往下一砍，就把虎尾巴砍下来。
老虎一惊，逃走了。
杜老汉女儿听到动静，放下手中针线，只见父亲呆若木鸡，片刻间才回过神来。
杜老汉马上把刚才发生的事情告诉女儿，父女商量着赶快逃走，否则性命难保。
杜老汉父女两人连夜出走，到了藩垣楼。
黄氏族人听说杜氏父女有难，纷纷问长问短，杜氏甚是感激。
然后，一户人家留他们歇息。第二天一早，杜氏回到山上看时，草寮就已被老虎扒得全部倒塌，破烂不堪。
黄梧听后深感惊奇，便问：“果真有这回事吗？”
堂叔说：“千真万确，这只是半年前的事。”
黄梧点了点头：“虎气冲天，太危险了！”
然后，黄梧又看看这间破厝，只见厝后的龙山如开锅出珠串，像虎尾一样卷来卷去，左右侧山连山。堪舆书云：龙虎重重起，世代多官取。